הרב חיים דרוקמן, ראש ישיבות בני עקיבא מחה על החקירה נגד הרבנים החתומים על "מכתב הרבנים". הרב דרוקמן כתב ליועץ המשפטי לממשלה, יהודה וינישטיין כי "זכותם וחובתם של רבנים להביע דעת תורה גם בנושאים ציבוריים".
"פסקי הלכה אינם גזענות המאבק על זהותה היהודית של מדינת ישראל הוא חלק מרכזי בתפקיד רבני ישראל", הוסיף הרב דרוקמן.