וועד רבני המטה להצלת העם והארץ מגנה בחריפות את ההחלטה לחקור את הרב שמואל אליהו בעוון גזענות, "מדובר בפשע נגד העם היהודי, במטרה אחת ויחידה להשפיל את רבני ישראל ותורת ישראל".
"מרצים וחברי סגל שמנהלים הסתה נגד קיומה של המדינה וקריאות לרצח נגד דתיים ומתנחלים באוניברסיטאות אינם נחקרים. אנו קוראים לרב שמואל אליהו לא לשתף פעולה הם החקירה הפוליטית, שמזכירה ימים אפלים בדברי ימי עם ישראל", הוסיפו רבני המטה.