יו"ר ועד מתיישבי השומרון, בני קצובר, אמר הבוקר כי מינויו של ניצן אלון כאלוף פיקוד מרכז הוא מינוי פוליטי של שר הביטחון.
בראיון לגלי צה"ל אמר קצובר כי אלון "מתנהל פוליטית, ושר הביטחון אהוד ברק ממנה אנשים פוליטיים". הוא הוסיף כי גם מינויו של שי אביטל לתפקיד ראש מפקדת עומק הוא מינוי פוליטי, ואמר כי אביטל תרם להגדלת הזהות בקרב מתיישבי יש"ע עם נוער הגבעות בגלל התבטאויותיו נגד ההתיישבות.