סוללה של כיפת ברזל הייתה מושבתת במשך חודש וחצי, בגלל שהמבנה בו היא אוחסנה, בבסיס חיל האוויר בחצור, הוצף בסערה הגדולה בחודש ינואר. כך דווח בגלי צה"ל.
המערכת הושבתה כאשר נחל האלה, הזורם בסמוך לבסיס חצור, עלה על גדותיו כתוצאה מהגשמים הרבים. למערכת נגרם נזק כבד ולא ניתן היה להשתמש בה, בין היתר בכוננות שהוכרזה לאחר התקיפה בסוריה שיוחסה לישראל. לאחרונה היא חזרה לשימוש.