האקדמיה הלאומית למדעים הציעה להכפיף את פרס ישראל לגורם ממלכתי, כמו לשכת נשיא המדינה, כדי למנוע השפעות פוליטיות עתידיות על הענקת הפרסים.
בגילוי דעת של חברי מועצת האקדמיה נכתב כי הם רואים בדאגה את האירועים האחרונים הנוגעים למינוי ועדות הפרס, אירועים המטילים צל כבד על אחת הפנים היפות של מדינת ישראל.