במשרד להגנת הסביבה הופתעו לשמוע בכלי התקשורת כי משרד מבקר המדינה העביר מידע ליועץ המשפטי החושף חשש לפלילים בטיפול בנושא האמוניה.
"המשרד נדהם לשמוע מהתקשורת על ההאשמות החמורות האלו, ועד לרגע זה לא קיבל שום הסבר או מידע הנוגע אליהן", אמרו במשרד להגנת הסביבה.
עוד נכתב בהודעת המשרד כי "כי כל פעילות אנשי המשרד להגנת הסביבה בתחום זה נסמכה באופן מלא על המלצות של מומחי המקצוע בתחום מהארץ ומהעולם, ולוותה באופן צמוד על-ידי הגורמים המשפטיים, לאור העובדה שהנושא נדון בערכאות משפטיות שונות".