ראש מועצת בנימין, פנחס ולרשטיין, שלח מכתב לשרת החינוך בו ציין כי חל גידול של עשרה אחוזים בתלמידי בנימין, ולכן יש להעביר בהקדם את כיתות הלימוד לייעדן. וולרשטיין איים כי אם לא יועברו הכיתות הוא יאלץ להביא את כל התלמידים ללמוד במחסומים, במקום בהם הקראוונים תקועים.
מוסדות החינוך בתל ציון שבבנימין הופתעו לגלות כי עדין לא הועברו אליהם כיתות הלימוד. רפי בן בסט, סגנו של ראש מועצת בנימין, אמר כי עוזר שר הבטחון סירב לאפשר את העברת הכיתות הנ"ל לישובי בנימין מסיבות פוליטיות, "התפקיד שלי הוא פוליטי ובשביל זה אני כאן", אמר עוזר שר הבטחון לענייני התיישבות יעקב בכר. הם פנו לח"כ משה גפני, מיהדות התורה, וזה טילפן לעוזר שר הבטחון שמיהר לאשר את העברת הכיתות.
מקורות בבנימין מתחו ביקורת קשה על התנהלותו הכללית של בכר, והציגו אותו כפעיל של שלום עכשיו היושב בלשכת שר הבטחון "הוא דואג לתקוע כל דבר שהוא לטובת אנשי בנימין, הוא גם מודה בזה כי אמר למנהיגי יש"ע לא פעם, כי הוא ידאג להעביר כסף לכל העולם רק לא לתושבי בנימין, הוא יכול להיות העוזר של איסמאעיל הנייה. הוא צוטט כאומר 'אם אצטרך לאשר קראוון לאזור יהודה ושומרון אעדיף לחתוך את ידי".
דוברת מועצת יש"ע, אמילי עמרוסי אומרת כי יעקב בכר שמונה לעוזר שר הבטחון לענייני התיישבות, הוא איש של תנועת השמאל הקיצונית, 'שלום עכשיו', "האיש דואג לאינטרס ההפוך של ההתישבות, ידוע לנו על דברים קשים שאמר נגד המתנחלים, התרשמנו ממנו בעת פגישתנו על המאחזים, הוא היה נגדנו במשך כל הפגישה, גם שהצגנו לו נתונים על מאחזים לא מורשים של הבדואים בנגב, הוא אמר שאי אפשר להשוות את המקרים, כי המתנחלים זוכים ליחס מועדף בעוד הבדואים מקופחים".
בשיחה עם איש ערוץ 7, תושב ירושלים, אומר יעקב בכר כי לדעתו "גם חלקים בירושלים נחשבים התנחלות", כך לדבריו.
יעקב בכר אמר בתגובה לערוץ 7 כי כדי לקבל אישור להעברת הקראוונים יש צורך להצטייד בשני אישורים אישור של משרד החינוך ואישור טאבו, "פנחס ולרשטיין הוא פרובוקטור מדרגה ראשונה. יעידו ראשי מועצות ביש"ע שבהתקיים שני התנאים האלה אני מאשר העברת קראוונים והם זוכים לכל עזרה ממני. אני עובד מדינה מחוייב לחוק. כל מי שעבד איתי באופן פתוח והגון זכה לכל הסיוע. וולרשטין חושב שהוא מעל החוק במדינת ישראל והחוק לא מעניין אותו". בכר אמר כי "ולרשטיין מקריב את תושביו על מזבח המאבקים שלו". באשר לעניין מפת ארץ ישראל מטעם שלום עכשיו שתלויה בחדרו אמר כי "שלום עכשיו אינו מוקצה אך מעולם לא נשרמתי בתנועה כחבר, אני מחזיק את המפה מתוקף תפקידי כדי לתת דו"חות למאחזים לא חוקיים חדשים שצומחים ביש"ע".
פנחס ולרשטיין הגיב לדבריו: האישורים הוגשו לבכר בהתאם לחוק, על מקומות בעייתים לא הוגשה בקשה, מתוך 74 כיתות הוא אישר רק 4 כיתות לימוד "האיש הזה הפועל מטעם שלום עכשיו מתנכל להתיישבות, בושה למדינת ישראל שאדם כזה עובד בשרות הציבורי. אני מתבייש שתושבים צריכים להתחנן כדי לקבל קראוון למוסודות לימוד. למרות האישורים שהגשתי אושרו רק שני מבנים לתל ציון בבנימין ולכן נאלצתי להעביר מבנה לישוב אדם למרות שבכר לא אישר, שינסה לפנות אותו משם".
ולרשטיין הוסיף "בכר הוא אדם חצוף ומעניין יהיה לדעת אם הוא יתנהג בצורה דומה גם אם מדובר בערבי או בדואי בנגב".