תחקירי נסיון החטיפה בשבת בכיסופים מעלים מספר נקודות מדאיגות במערכת הביטחון. בצה"ל מוטרדים מכך שלניסיון החטיפה בשבת לא היתה התראה ספציפית, דבר המעיד על בעייתיות במודיעין מהרצועה.



"מהעובדה שהג'יפ לא חדר לשטחנו אפשר להעריך כי המחבלים התכוונו לחטוף חייל ולהימלט במהרה", אומרים בצה"ל.



על פי התחקיר מתברר כי המחבלים שהשתתפו באירוע היו מאומנים היטב. אחד המחבלים הצליח במשך יותר משעה לרתק את חיילי צה"ל, ושלושה מחבלים הצליחו לחזור הביתה בשלום משטח ישראל, דבר המלמד על רמת חיילות גבוהה. בקרב גורמים צבאיים ישנה מחלוקת האם המחבלים שביצעו את ניסיון החטיפה בשבת, ידעו שהפילבוקס עליו הסתערו תחילה מאוייש או לא. תחילה רווחה ההערכה שהמחבלים הסתערו על הפילבוקס כיוון שחשבו שהעמדה מאויישת, והם ביקשו לחטוף מתוכה חיילי צה"ל. המחבלים חדרו את השער עם ג'יפ מוסווה כרכב של עיתונאים. תצפית זיהתה את הג'יפ החשוד, והקפיצה את הכוחות.



עם זאת עולה כעת ההערכה, שהמחבלים ידעו שהמבנה איננו מאוייש. זאת כיוון שהמחבלים קיימו תצפיות ואספו מודיעין רב לפני הפעולה.



על פי אחת ההערכות, המחבלים תיכננו להסתער על עמדה מאויישת של צה"ל, אולם אחרי שפרצו את הגדר הם הבינו שחיילי צה"ל זיהו אותם, ולכן הסתערו על הפילבוקס – מבנה עגול המשמש כיום כמוצב צבאי ביו"ש ובגבול הרצועה – במגמה להתבצר בתוכו, ולנהל משם את הקרב מול חיילי צה"ל, בהנחה שחיילינו יתקשו לפרוץ אל תוך המבנה המבוטן והמבוצר היטב.



ככל הנראה, המחבלים לא הצליחו לפרוץ את דלת הפילבוקס, ולכן שלושה מהם מיהרו לסגת בחזרה לרצועה. המחבל הרביעי, שמראש שימש כ"רתק" שתפקידו היה לרתק את חיילי צה"ל כל עוד ניסיון החטיפה נמשך, שכב בתעלת ביוב ומשם ניהל קרב יריות עם חיילי "גבעתי". גורמים פלשתינים אומרים כי מדובר במוחמד ח'ליל ג'עברי, בן 19.