בבוקר יום ו', ערב יום הכיפורים, הושלמה פעילות כוחות צה"ל לסיכול תשתיות הטרור במחנה הפליטים עין בית אילמא בשכם, במהלכה עצרו הכוחות 49 מבוקשים, ביניהם מבוקשים בכירים אשר תכננו לבצע פיגועים בעורף ישראל. כמו כן, חשפו הכוחות כלי-נשק, חומרים להכנת מטענים ואמצעי לחימה נוספים.
החל מיום ג' פעלו כוחות צה"ל, משמר הגבול ושירות ביטחון כללי במחנה הפליטים עין בית אילמא בשכם, במטרה לפגוע ולסכל את פעילות תשתית הטרור הענפה במחנה הפליטים ולמנוע הוצאת פיגועים לעורף ישראל ולמרחב יהודה ושומרון. המבצע החל בעקבות ריבוי ההתרעות על כוונתם של ארגוני הטרור במחנה להוציא לפועל פיגועי טרור רצחניים.
חייל צה"ל, סמל-ראשון בן ציון חיים הנמן ז"ל, נהרג, וחייל נוסף נפצע באורח קל, בחילופי אש בין כוחות צה"ל למחבלים חמושים. בפעילות הרגו חיילי צה"ל שני מחבלים חמושים, ביניהם את המחבל אשר ירה והרג את סמל-ראשון הנמן ז"ל.
שלושה מטעני חבלה הושלכו לעבר הכוחות וכמו כן חילופי אש התפתחו במספר רב של מקרים בין כוחות צה"ל לבין מחבלים חמושים.
בסריקות שערכו הלוחמים במבני מגורים, בסליקים ובמערות במחנה הפליטים, נחשפו: רימונים, כלי-נשק, חומרים להכנת מטענים, מנגנונים להפעלת מטענים, ציוד צבאי ותחמושת. אמצעי הלחימה הוחרמו וחומרי הנפץ פוצצו באופן מבוקר על ידי חבלנים.
במהלך הפעילות עצרו כוחות צה"ל 49 מחבלים מבוקשים, פעילי ארגוני הטרור חמא"ס ו'החזית העממית'. המחבלים המבוקשים הועברו לחקירת כוחות הביטחון. אור ליום שישי עצר כוח מיוחד של צה"ל את ניהאד ראשיד חסאן שקיראת, מחבל מבוקש בכיר המשמש כראש תשתית ארגון הטרור חמאס במחנה הפליטים עין בית אילמא.
ניהאד שקיראת, יליד 1973, הסתתר במבנה מגורים עד אשר יושבי המבנה, שחששו מהלחץ שהפעיל צה"ל במטרה לעוצרו, הכריחו אותו לצאת מהמבנה. בחקירתו של ניהאד שקיראת, הודה כי העביר חגורת נפץ אל מהד אשור, תושב שכם העובד בתל אביב. בעקבות החקירה, עצרו כוחות צה"ל אמש את מהד אשור, אשר הוביל את הכוחות לסליק ובו חומרים להכנת חומרי נפץ. בחקירתו, מסר כי קיבל לידיו חגורת נפץ מניהאד שקיראת והעבירה לתל אביב לשם ביצוע פיגוע חבלה בעורף ישראל.
בסריקות שערכו החיילים במבנה מגורים נתקלו הכוחות באישה פלשתינית הרה אשר ישבה על מיטה וסירבה לקום בטענה כי אינה חשה בטוב וכי אין במקום שום דבר חריג. הכוחות, שהמשיכו בסריקת המקום, חשפו מתחת למיטת האישה ההרה סליק.
במקרה נוסף, עצר כוח צה"ל פעיל טרור בעת שהיה מחופש ולבוש בבגדי אישה, על מנת לתעתע בכוחות צה"ל המחפשים אחריו.
עוד עצרו הכוחות את חאלד נורי, יוסף נאדי ומוצטפא נורי, פעילי טרור מארגון הטרור חמא"ס, השלושה הועברו לחקירת כוחות הביטחון. בחקירה ראשונית בשירות ביטחון כללי הודו השלושה בתכנון פיגועים ובכלל זה ברצונו של מוצטפא נורי להתאבד בפיגוע רצחני. חברי החוליה השיגו את אמצעי הלחימה לביצוע הפיגועים מראשי תשתית ארגון הטרור חמא"ס באזור. עם מעצר חברי החוליה סוכלו, למעשה, כוונותיהם להוצאת פיגועים.
בנוסף, עצר כוח צה"ל את חמיס ווליד חמיס מרעי, יליד 1979, פעיל בכיר בארגון הטרור "החזית העממית".