ארגון השמאל, האגודה לזכויות האזרח, קוראת ליישם את המלצתה של ועדת וינוגרד לחקור אירועים ופעולות צבאיות אשר על פי החשד גרמו להפרה בוטה של כללי המשפט ההומניטארי. יחד עם זאת, האגודה מביעה אכזבה קשה מהחלטתה של ועדת וינוגרד שלא לחקור לעומק בעצמה את החשדות הללו וקוראת לפתיחה בחקירה עצמאית של הנושא על ידי גורם חוץ-צבאי.



בספטמבר 2006 פנתה האגודה לזכויות האזרח לועדת וינוגרד בדרישה לברר במסגרת חקירותיה גם חשדות להפרת כללי המשפט ההומניטארי, לרבות הפרה בוטה של עקרון ההבחנה בין מטרות אזרחיות לבין מטרות צבאיות. האגודה דרשה לחקור את השימוש בפצצות מצרר בשטחים בנויים, הרג עשרות אזרחים חפים מפשע בהפגזת בניין המגורים בכפר קאנא, וכן התבטאויות של מספר שרים בממשלה, אשר קראו "לשטח כפרים שלמים" בדרום לבנון.



"האגודה תמהה ומאוכזבת מהחלטת הועדה שלא לחקור בעצמה סוגיות אלה ולהסתפק בהערות כלליות, בהתבסס בין השאר על נכונותה של ישראל לחקור תלונות על פגיעה בלתי מוצדקת באוכלוסייה אזרחית. זאת, תוך התעלמות מהעובדה, כי התחקירים שבוצעו עד כה בנושאים אלו היו תחקירים שערך הצבא, אשר מטבע הדברים ועל סמך ניסיון העבר המר, אינם יורדים לשורש האמת", נמסר בהודעת האגודה.



האגודה קוראת לפתיחת חקירה פלילית עצמאית של גורם חוץ-צבאי, לצורך בדיקת אחריותם האישית של כל המעורבים בשימוש בתחמושת מצרר. בנוסף, קוראת האגודה למערכת הביטחון למסור מפה של האזורים בהם הופלו פצצות מצרר כדי לסייע לגורמים הומניטאריים לנטרל את סכנת הנפלים שטרם התפוצצו ולחסוך בכך חייהם של אזרחים תמימים, אשר עדיין עלולים להיפגע מהם.