ראש עיריית מינכן החליט לבטל את הרצאתו של ההיסטוריון האנטי ציוני פרופ' אילן פפה, בעקבות פניית האגודה הישראלית גרמנית של מינכן שטענה כי הרצאתו תהפוך למופע תעמולה אנטי ישראלי. בתגובה שלח פרופ' פפה מכתב לראש העיר ובו הוא משווה את ההחלטה למנוע ממנו לדבר להחלטה של הנאצים בשנות השלושים להשתיק את מתנגדיהם.
פרופ' פפה שעזב את ישראל בסוף שנת 2007, חי כיום באנגליה ומפיץ את משנתו שתומכת בהתנגדות החמאס לכיבוש הישראלי. פפה ומספר אקדמאים ישראלים אחרים, המזוהים עם השמאל הקיצוני, קידמו או תמכו ביוזמת חרם על ידי איגוד המרצים הבריטי (AUT). היוזמה הובילה בסופו של דבר להטלת חרם באפריל 2005 על ידי האיגוד על אוניברסיטת בר-אילן ועל אוניברסיטת חיפה.
פרופ' שלום רוזנברג מהאוניברסיטה העברית בירושלים אומר בראיון לערוץ 7 כי מעשיו של פרופ' פפה הם שפלות ממדרגה ראשונה, "הבן אדם הזה הוא אחד מאלה שפועלים למען הטלת חרם על מדינת ישראל. לא אכפת לו מהנזק שהוא גורם".
פפה פעל בבריטניה להטלת חרם על אוניברסיטת בר אילן בשל חסותה האקדמית למרכז האוניברסיטאי אריאל שבשומרון ואת אוניברסיטת חיפה בשל התנכלות, כביכול, כלפיו.
כזכור בזמנו הגן פפה על עבודת תזה של תלמידו תדי כץ שקבעה שב- 1948 ביצעו חיילי חטיבת אלכסנדרוני טבח בתושבי הכפר טנטורה. כץ נתבע לדין על ידי ותיקי החטיבה והוכח שהוא סילף עדויות, הוא נדרש על ידי בית המשפט לפרסם התנצלות. בעקבות האירועים החליטה אוניברסיטת חיפה לפסול את עבודתו של כץ. אילן פפה המשיך לטעון כל השנים כי עבודתו של תלמידו כץ הייתה אמינה ושהיה טבח בטנטורה, הוא האשים את אוניברסיטת חיפה בהתנכלות לחופש האקדמי. בחודש מאי 2002 פנה דיקן הפקולטה למדעי הרוח באוניברסיטה דאז, פרופ' יוסי בן ארצי, לבית הדין המשמעתי של האוניברסיטה בבקשה לסלק את פפה מהאוניברסיטה, מאז כאמור הוא ממשיך להלחם באוניברסיטת חיפה.
פרופ' רוזנברג מציין שפפה החליט מאז להלחם במדינת ישראל, "פסלו לתלמידו את הדוקטורט והוא ראה בזה סתימת פיות, הוא טען שהמרצים פה סותמים את הפיות של אילן פפה ותלמידו כץ, והוא הפך את זה למלחמה. זאת אפילו לא חוצפה, זו שפלות שאין כמוה, טוב עשתה גרמניה שהחליטה שהוא לא יוכל להרצות בעיר מנכן. תבוא עליהם ברכה על כך".
לדבריו מי שסותם פיות זה דווקא פפה וחבריו, "הם הורידו את המלחמה האקדמית לרחוב, בדיוק כמו שקרה בגרמניה של הנאצים. אם אני פרופ' שלום רוזנברג אבוא להרצות באירופה, הם וחבריהם יבואו להפגין נגדי ולא יתנו לי לדבר, הם ישברו הכול ואולי אפילו ינסו לפגוע בי אישית, והם וחבריהם מהשמאל הקיצוני הבלתי שפוי הזה עוד מעיזים לדבר על חופש ביטוי. אנחנו יודעים מה זה חופש ביטוי, שבכל מקום שיבוא יהודי ישראלי להביע את דעתו הציונית מייד יהיו אסיפות של מוסלמים ופלשתינים. הם אלה שמשתיקים אותנו ולא ההפך, צריך לגנות את האיש הזה אבל במקביל אני קורא לכולם אל תגעו בו פיזית".