רב הכותל המערבי, הרב שמואל רבינוביץ, מגיב בחריפות לטענות כאילו החפירות הארכיאולוגיות באזור הכותל פוגעות במתחם הר הבית.
"מדובר בפתיחתה של מערכת ניקוז שהתגלתה כבר במאה ה 19 על ידי החוקר האנגלי צ'ארלס וורן והשלמת חשיפתה נעשתה בימים אלו. המערכת פרוסה לצד הכותל המערבי, מחוץ להר הבית, ושירתה את הרחוב הראשי הסמוך לו", אמר הרב.
"הר הבית עצמו מוקף קירות אבן במשקל עשרות אלפי טונות, ואיש אינו חופר דרכו אל מתחת להר הבית - הן בשל האיסור ההלכתי המפורש והן בגלל שהדבר פשוט אינו אפשרי. כל ניסיון לטעון שהחפירות פוגעות בהר הקדוש אינן אלא שקר גס, שמטרתו היחידה היא ליבוי אש מיותרת ומזיקה באזור המקודש לכל הדתות. פעילות החשיפה באיזור העיר העתיקה אמנם מגלה את שורשינו בירושלים אך אין מטרתה לפגוע בדתות האחרות. אני קורא למנהיגים בעיר העתיקה לא לתת יד לפגיעה במרקם העדין שבעיר העתיקה".
במשך תקופה ארוכה – כשבע שנים – ערכו ארכיאולוגים של רשות העתיקות חפירות שחלקן בוצעו בקרבת הר הבית. "התעלה ממוקמת מתחת לרחוב המרכזי המרוצף והמדורג שחצה את העיר ירושלים, בסמוך לכותל המערבי בצפון ועד לבריכת השילוח שבעיר דוד בדרום", נמסר בהודעת רשות העתיקות. משטרת ירושלים נערכת במקום כדי למנוע הפרות סדר.