באיראן מתחזקת התחושה שהסכם הפיוס בין פתח לחמאס יקל על פעילות הטרור הפלשתינית ביהודה ושומרון.
מכון ממר"י מצטט דברים המובאים ביומון האיראני 'כיהאן' המקורב למנהיג עלי ח'אמנאי, ובהם נאמר כי "החלק החשוב בהסכם הוא נרמול המצב הביטחוני בין הפלגים בעזה (חמאס) ובגדה (פת"ח) ומתן אפשרות לקבוצות הג'יהאדיות לפעול בגדה וברצועה".
להערכת העיתון צפויה התנגדות מטעם הרשות הפלשתינית לחזרתן ליהודה ושומרון של תנועות הג'יהאד והחמאס, אולם גם אם תהיינה התנגדויות שכאלה על פי ההערכות האיראניות יוכלו ארגונים אלה לפעול בגלוי ברחבי יו"ש "באופן שישים קץ לשקט לו זכו הציונים בגדה בשנים האחרונות", כלשונם.
לטעמם של אנשי היומון ההסכם בין פלגי הפלשתינים יסכל את מאמצי ישראל לעכב את הקמת המדינה הפלסטינית בעצרת האו"ם בספטמבר ויגביר את ביטחונם העצמי של הפלסטינים ואת יכולתם להתמודד עם משברים בעתיד.
באשר למקום בו עלה בידי הפלשתינים לגבש את ההסכם, קרי קהיר, כותבים אנשי העיתון כי "הסכם הפיוס בין פת"ח לחמאס בקהיר, מסמל את השינוי שחל במשטר במצרים ורומז כי הדבר מבשר את ניצחון הזרם האסלאמי בקרב הפלסטינים ובמצרים".
כאן המקום להזכיר את המלצתו של המרכז למחקרים של המג'לס, הפרלמנט האיראני, להרחיב את הקשרים עם מצרים כדי לאפשר לאיראן לשפר את מעמדה האיזורי ואת יכולתה לאסוף מודיעין בנוגע להתפתחויות בזירה הפלשתינית.