במהלך הלילה פרצו אלמונים לסדנת החימוש של בסיס חטיבת בנימין בבית אל והשחיתו שלושה עשר כלי רכב וצמיגי גלגלי הרכבים נוקבו, החלונות נופצו ורוססו כתובות "תג מחיר" ו"ד"ש ממגרון".
מצה"ל נמסר כי משטרת ישראל פתחה בחקירת האירוע. "בצה"ל רואים אירוע זה בחומרה", אומרים בצבא.
עם קבלת המידע אודות האירוע יצר מפקד פיקוד המרכז, אלוף אבי מזרחי, קשר עם מפקד מחוז ש"י של המשטרה, וציין בעקבות האירוע כי "הפניית זעם כלפי קציני צה"ל במטרה להרתיעם מלבצע משימות חוקיות, החלטות ממשלה והחלטות בית המשפט העליון פסול וראוי לכל גינוי. בכוונתי ביחד עם גורמי אכיפת החוק לתפוס את האחראים לכך ולמצות עימם את הדין".
שר הביטחון, אהוד ברק, אמר בעקבות האירוע כי "הפריצה לבסיס והפגיעה ברכבים הם מעשה נקלה של עבריינים שייתפסו בקרוב. מעשי הונדליזם נגד ישראלים ופלסטינים נועדו לשבש את שגרת החיים ביהודה ושומרון ולגרום להסלמה בתקופה רגישה זו. אני משוכנע כי משטרת ישראל וכוחות הביטחון יתפסו במהרה את העבריינים".
בתגובה לדיווח נמסר ממועצת יש"ע כי "מועצת יש"ע מגנה בחריפות את הפעולה החבלנית שנעשתה הלילה בכלי רכב צבאיים מבצעיים בשטח בסיס אוגדת יהודה ושומרון. על מבצעי הפשע להסגיר את עצמם מיד לידי המשטרה ועל כוחות הביטחון לפעול בנחרצות כדי לעקור מן השורש את התופעה הנלוזה הזו".
עוד קובעים במועצה כי המעשה הוא "פשע מוסרי מהסוג החמור ביותר, שמסב נזק אדיר להתיישבות היהודית ביהודה ושומרון ומנוגד לערכיהם ומצפונם של מאות אלפי הישראלים החיים באזור, הכואבים לא פחות מהפושעים את הרס שלושת המבנים השבוע במגרון".
ח"כ נחמן שי (קדימה) התייחס גם הוא לאירוע ואמר כי "לכשיגיע האירוע הבא, והוא עלול להיות פגיעה בנפש, אל תגידו שלא אמרנו. הכתובה היא באמת הפעם על הקיר והיא אומרת שבמדינת ישראל פועלת מחתרת של יהודים שפגיעתה רעה ומסוכנת. אם הם לא יעצרו עכשיו, איש לא יעצור אותם בעתיד".
הפורום המשפטי למען ארץ ישראל מצטרף למגנים את מבצעי המעשה ומגיב לאירועים: "מי שפגע בבסיס צה"ל הוא עבריין נקלה שפוגע בהתישבות ביהודה בשומרון ומבקש להטיל קלון על מאות אלפי אזרחים שומרי חוק שעומדים על זכויותיהם כחוק, מבלי להרע לאיש. העבריינים הללו פוגעים בהתישבות יותר משלום עכשיו ויתר שונאי ההתישבות ויש למצות עימם את הדין".