הרב הצבאי הראשי, הרב רפי פרץ, מגנה את הדרת הנשים הקיימת בחברה החרדית. באגרת ששלח לקציני צה"ל התייחס הרב פרץ לסערה בבית שמש, ולדיווחי התקשורת השונים.
"בעת האחרונה אנו עדים לתופעה חמורה שבה נשים מופלות לרעה מחוץ לצבא ואף, לצערי הרב, אנו שומעים על מספר מקרים של אפליית נשים בתוך צה"ל. אני מתקשה לעמוד מנגד נוכח מקרים חמורים מעין אלו. מקרים אלו אינם מוסריים, אינם תואמים את דרך צה"ל ואת ערכיו ועומדים בניגוד מוחלט לרוח היהדות.
רוח ההלכה היהודית אינה מאפשרת בשום אופן אפליה או פגיעה בנשים, על כל רקע ועל שום ביסוס.
ילדה קטנה השרויה בפחדים בעטיו של קוד לבוש שונה במעט, הפרדת מדרכות על רקע מגדרי וכפייה דתית, עומדים בניגוד מוחלט לרוח היהדות הדוגלת בהליכה משותפת, ברעות ובאחווה. אין כל מקום לפרשנויות קיצוניות ושגויות של ההלכה המשמשות תירוץ לאפליית נשים לרעה. הרוח היהודית, מסורת אבותינו, דורשת לכבד את האישה.
בצה"ל, פקודות הצבא, הן ורק הן, מכתיבות את אופיו של הצבא ואת האווירה השוררת בו, וקובעות מה יש לעשות במקרים השונים. מהיכרותי עם פקודות אלו, אני יודע בוודאות כי הן אינן מותירות כל מקום לאפליה לרעה של נשים.
אני, כרב הראשי לצה"ל, פועל למען ההליכה המשותפת של מערכת הפקודות הצבאית עם מערכת הערכים ההלכתיים ולהליכה משותפת של כל חיילי צה"ל, מכל רקע ומכל סוג שהוא, על מנת למנוע מקרים, ולו בודדים, של אפליית נשים בשם הדת בתוך הצבא. אני פועל לכך שלא יחלחלו לתוך הצבא רעיונות קיצוניים ומוטעים המהווים רקע לאירועי אפליית נשים בחברה הישראלית. מחדלי בית שמש לא יהיו בצה"ל.
ההליכה המשותפת בצה"ל, משמעותה כי הפרט אינו מעצב את המרחב הצבאי, אלא מכבד אותו יודע כי הצבא עושה הכל על מנת לכבד את הפרט.
בתלמוד הירושלמי נאמר על דורו של אחאב מלך ישראל: "ועל ידי שלא היה להן דילטורין, היו יורדים למלחמה ונוצחין". בדורו של אחאב היו מנצחים במלחמות בגלל האחדות ששררה בעם, שלא היו מדברים רעות איש על חברו. אני מקווה שגם היום, בדורנו, רוח האחדות תגבר ומתוכה נוכל לנצח".