טיוטת דו"ח המבקר בנושא "פרשת הרפז", אשר הועברה למבוקרים אחר הצהריים, כוללת ביקורת קשה גם על לשכת הרמטכ"ל לשעבר אשכנזי וגם על לשכת שר הביטחון ברק.
בין השאר קובע מבקר המדינה, כי בין שתי הלשכות שררה "אווירת מלחמה", וכי בין לשכתו של אשכנזי לבין בועז הרפז שררו יחסים בלתי תקינים.
עוד נקבע, כי עקב האווירה המתוחה וחוסר התקשורת בין הלשכות נוצרו אי סדרים חמורים כדוגמת עיכוב מינויים ותקלות נוספות.
למרות כל זאת, המבקר לא מצא כל ראיה לכך שהרמטכ"ל לשעבר, גבי אשכנזי, היה מעורב בזיוף המסמך שכונה תחילה "מסמך גלנט" ולאחר מכן "מסמך הרפז".
עוד נקבע בטיוטת הדו"ח, כי למרות הממצאים החמורים בנוגע לפעילות בשתי הלשכות, לא נמצאו ראיות לביצוע מעשים פליליים על ידי מי מהמבוקרים בפרשה.