מתוצאות לא רשמיות של הבחירות לנשיאות במצרים עולה, כי מוחמד מורסי, מועמד האחים המוסלמים זכה ברוב קולות בבחירות והוא יהיה הנשיא הבא של מצרים לאחר הדחתו של הנשיא חוסני מובארק.
דר' אחמד עבד אל-עאטי, המתאם הכללי של קמפיין הבחירות של מוחמד מורסי, מסר במסיבת עיתונאים, כי על בסיס נתוני 97.66 אחוזים מכלל הקלפיות מורסי קיבל 12,743,000 קולות, ואילו יריבו אחמד שפיק קיבל 11,846,000 קולות בלבד. לאחר הוספת קולות האזרחים המצרים שהצביעו בחו"ל מורסי קיבל 52.5 אחוזים מהקולות ואילו שפיק 47.5 אחוזים מהקולות.
לאחר היוודע תוצאות הבחירות, שכאמור אינן רשמיות, אמר מוחמד מורסי, כי עם תחילת כהונתו כנשיאה של מצרים יפעל להגיע להסכמה לאומית עם כל הגורמים הפוליטיים. הוא הודה למצביעים עבורו והדגיש, כי "נהיה יד אחת לעתיד טוב יותר בדרך לחירות, דמוקרטיה ושלום". בניסיון להרגיע את האופוזיציה אמר מורסי, כי הוא מגיע לנשיאות עם מסר של שלום ופיוס ולא נקמה או חיסול חשבונות.
ובתוך כך, משבר חדש קורם עור וגידים במצרים. המועצה הצבאית הכריזה על תיקונים לחוקה, המעניקים לה סמכויות יתירות. כך למשל, לנשיא מותר להכריז על מלחמה או להפעיל כוחות צבאיים לדיכוי מהומות רק לאחר אישור המועצה הצבאית העליונה. נוסח החוקה החדש מבהיר, כי אם קיימת סתירה בין האינטרס של המולדת לראש המועצה הצבאית העליונה, לראש הממשלה או לנשיא בית המשפט העליון תהיה סמכות להתנגד לעמדת הנשיא ואם לא תושג הסכמה הדבר יוצג לשם הכרעה בסוגיה בפני בית המשפט החוקתי העליון.
במערכת הפוליטית נשמעות תגובות ביקורתיות נוקבות נגד החוקה החדשה, הנתפסת ע,י התנועות האסלאמיות ומפלגות השמאל כניסיון של המועצה הצבאית לסכל את הישגיה של המהפכה. ב-30 ביוני צפויה הפגנת המונים נגד "ההפיכה החוקתית".