בדו"ח מיוחד שמפרסם מרכז המידע למודיעין ולטרור מגוללים אנשי המכון את עלילותיו של פתחי חמאד, שר הפנים בחמאס, האחראי מתוקף תפקידו על אכיפת הרגיעה ברצועת עזה. מהדברים מתברר כי האיש עוסק בה בעת, גם בהפעלת חוליות טרור ובקידום פיגועים ביהודה ושומרון.
מהדו"ח עולה כי בחודשים שחלפו מאז מבצע "עמוד ענן", עשו פעילי חמאס ברצועת עזה ובמרכזם פתחי חמאד, שר הפנים בחמאס, מאמץ להפעיל תשתית טרור ביהודה ושומרון לשם ביצוע פיגועים נגד ישראל.
בין הפיגועים שתוכננו היו פיגועי התאבדות, חטיפת חיילים ואזרחים ופיגועי הרג. לעומת זאת מקפידה חמאס, מאז מבצע "עמוד ענן", לשמור על השקט בדרום ישראל ואף מנסה לכפות אותה על ארגוני טרור "סוררים". בשני היבטים אלו של מדיניות חמאס נוטל חלק פתחי חמאד שר הפנים והאחראי על מנגנוני ביטחון הפנים של ממשל חמאס.
במסגרת פעילות הסיכול של כוחות הביטחון הישראליים, נחשפה בתחילת 2013 חולית פעילי חמאס מאזור ראס כרכר וסילואד (אזור בנימין). חברי החוליה התכוונו לבצע פיגועים דוגמת הנחת מטענים, חטיפת חייל או תושב יהודה ושומרון ושיגור רקטות מייצור עצמי.
חברי החוליה קיימו קשר עם רצועת עזה באמצעות האינטרנט וטלפונים מבצעיים וקיבלו הדרכה בייצור אמצעי לחימה. לגבי פעולת החטיפה קיבלה החוליה הוראות קונקרטיות לחטוף חייל, לקחת ממנו את תעודת הזהות והטלפון הסלולארי שלו לצרכי משא ומתן ולאחר מכן להרוג אותו ולקבור אותו במקום מסתור. עם מעצרם היו חברי החוליה בשלבים מתקדמים של הכנות לפיגוע ואף העבירו מסר לרצועת עזה כי הם מוכנים לפעול תוך מספר ימים.
הדו"ח מדגיש כי תשתית הטרור, שנחשפה ביהודה ושומרון, עמדה בקשר עם מקורביו של פתחי חמאד.
בתקופה, שחלפה מאז מבצע "עמוד ענן", היה פתחי חמאד מעורב בניסיונות להוציא לפועל ביהודה ושומרון פיגועים קשים הן באמצעות מקורביו, פעילי חמאס והן באמצעות ארגון טרור המכונה "מגני אלאקצא", אשר פתחי חמאד משמש כפטרונו.
אנשי מרכז המידע למודיעין ולטרור מציינים כאמור כי פתחי חמאד, בתוקף היותו שר הפנים אחראי על מנגנוני הביטחון האוכפים את ההרגעה, שהושגה בסיום מבצע "עמוד ענן". מעורבותו בהכוונת פיגועים ביהודה ושומרון חושפת פעם נוספת את "הכובע הכפול" אותו נושא פתחי חמאד כמפעיל חוליות טרור וכאוכף מדיניות ריסון. מעבר לכך מתקיים מזה שנים ארוכות שיתוף פעולה הדוק בין מנגנוני הביטחון, שפתחי חמאד עומד בראשם לבין גדודי עז אלדין אלקסאם, הזרוע הצבאית – טרוריסטית של חמאס.