רב העיר רחובות, הרב שמחה הכהן קוק, השתתף בכנס רבני ההתיישבות ותקף במהלכו את הניסיון לפגוע בעולם התורה ולגייס את בחורי הישיבות.
לדבריו, "ישנה תנועה אדירה של אהבת תורה ורצון לתורה ואלו שמבינים את זה רוצים להילחם בזה, הם מבינים שהעם הזה הולך ומשתנה לטובה ולא לרעה".
הרב קוק טען, כי "רק יחידים ישנם כאלה שבכנסת ובממשלה וצועקים "אני מחלל שבת" יש כאלו ולא היה כזאת, אדם חילל שבת הרכין את הראש וחילל שבת, אבל לשבת בכנסת ולומר את זה, או אדם שממונה על החינוך וקורא לבחורי הישיבות - פרזיטים".
הרב קוק סיפר, כי "כל ראש ממשלה ושר ביטחון, זה היה בן גוריון בהתחלה, ואחר כך יצחק רבין, כל ראשי הממשלות לסוגיהם רצו לגייס את בחורי הישיבות אך אף אחד לא גייס אותם. מדוע? כי ישבו עם ראשי הישיבות, עם זקני הדור, ושבאו ושמעו את דבריהם, חפו פניהם, ואמרו אנחנו לא נגייס אותם ולא נגעו בהם. זו הפעם היחידה שאף אחד לא ישב עם ראש ישיבה, לא עם זקני הדור ולא עם צעירי הדור, לא דיבר איש עם עולם הישיבות על הרצון הזה, על הדבר הזה".
"אם נוגעים בתורה אחריתה מי ישורנו, מי יודע לאן הדברים האלו יכולים להגיע, צריך לומר את הדברים בקול צלול. ובאמת נכון שהרבנות הראשית לא אמרה מילה וחצי מילה על כך", ביקר הרב קוק את שתיקת הרבנים הראשיים.
הרב קוק המשיך ותקף את מועמדותו של הרב סתיו, אך בלא להזכיר את שמו, "הרב קוק זכר צדיק וקדוש לברכה לא היה מעלה על דעתו שהרבנות יכולה להגיע להתדרדרות כזאת, שישנם מועמדים שבאים ומכריזים שלא צריך קבלת מצוות על מנת להתגייר, אדם שאומר את זה כופר במעמד הר סיני. מי שלא מאמין שצריך קבלת תורה לא מאמין במעמד הר סיני".