המשטרה הודפת הערב (ראשון) את הביקורת בשמאל על פרשת הצוללות (תיק 3000) ומבהירה כי החקירה היתה מקצועית.
"החקירה נוהלה באופן יסודי ומקצועי, מתוך מטרה אחת ויחידה של בירור האמת. הטענות לפיהן חקירת תיק 3000 הוגבלה או צומצמה על-ידי מי מבכירי מערכת אכיפת החוק היא טענת כזב, חסרת כל בסיס עובדתי''.
במשטרה דוחים את הטענות ולפיהן היועץ המשפטי לממשלה הגביל את חקירת ראש הממשלה בפרשה. ''במסגרת החקירה נגבו הודעותיהם של בכירי המדינה ומערכת הביטחון בעבר ובהווה, וכל טענה שעלתה ואשר הצדיקה העמקת הבירור - נבדקה לעומקה. אין כל שחר לטענות שמרמזות את ההיפך''.