שר המודיעין אלי כהן הגיב בראיון ברדיו 103FM לתקיפה הישראלית נגד כוחות איראניים בסוריה והבהיר: "התבססות של איראן בסוריה היא מבחינתנו קו אדום, וכל הפרה של הריבונות של ישראל תיענה בחומרה".
על יוזמתי שר הביטחון גנץ להקים ועדת בדיקה לפרשת הצוללות אמר שר המודיעין: "ההחלטה של גנץ נובעת רק ממקום פוליטי, מההתרסקות שלו בסקרים והחשש שלא יעבור את אחוז החסימה... רק לפני כמה שבועות גנץ עצמו אמר שאין צורך בהקמת ועדה כזאת. הצוללות נחקרו במשטרה".