בתנועת נאמני תורה ועבודה הגיבו על דברי הרב יצחק יוסף נגד בוגרי ישיבות ההסדר.
"ישנו צורך קריטי בשינוי מנגנון הבחירה של רב ראשי, באופן שבו חייבים לצמצם את השפעת המרכיב הפוליטי, וזלזולו של הרב יוסף בעולם ישיבות ההסדר מזכיר לנו עד כמה הדבר חשוב".
"מיותר לציין שישיבות ההסדר מוציאות מתוכן תלמידי חכמים, רבנים ודיינים מוכשרים ביותר וזאת הודות לחיבור של קודש וחול, ספרא וסייפא וכו'. עם ישראל זקוק דווקא לרבני ערים היודעים לתווך את החיבור של התורה והמציאות".