אישים בכירים, בהם הרמטכ"ל, הרבנים הראשיים, אלוף פיקוד המרכז נכנסו הלילה (שישי) לקבר יוסף בעיר שכם כאורחים של מושל העיר מטעם הרשות הפלשתינית. כך נודע לערוץ 7.
גם רב המקומות הקדושים, הרב שמואל רבינוביץ', הגיע לביקור.
אף גוף רשמי בשומרון, וכן גם רבני השומרון, לא עודכנו מראש על הכניסה ולא הוזמנו להשתתף בה. לעומת זאת, הרשות הפלשתינית ומושל שכם עודכנו.
המהלך הלילה בוצע על אף שקבר יוסף הוקצה בזמנו ע"י ממשלת ישראל למועצה האזורית שומרון ולמועצה הדתית שומרון ואפילו לפי הסכמי אוסלו המקום נשאר בשליטת מדינת ישראל.
גורמים בשומרון מחו על המהלך וטענו כי מדובר בחלק מתוכנית רחבה במסגרתה מתכוונות הרשויות להעביר את קבר יוסף לשליטה פלשתינית, "אנחנו מופתעים מהמהלך שתוכנן מבלי לערב את הגורמים היהודים בשומרון הפועלים שנים למען שלמותו של קבר יוסף. לא נעבור לסדר היום על המהלך ונסכל את את זליגת השליטה בקבר יוסף בפועל לידי מחבלי הרשות הפלשתינית, אשר כזכור הם אלו שחיללו אותו ושרפו אותו שוב ושוב".
לאחר פרסום הידיעה בערוץ 7 הודיעו מתכנני הביקור כי יסכימו לצרף לסיור גם את הרב אליקים לבנון הרב האזורי של השומרון, וראש המועצה האזורית שומרון גרשון מסיקה ויו"ר מועצת יש"ע דני דיין, ואף אמרו כי מושל שכם לא יארח את המשלחת. אולם בסופו של דבר נמנעה כניסתם לקבר יוסף הלילה.
כבר עם שיפוץ הקבר בחודשים האחרונים עירבו הרשויות את הרשות הפלשתינית בשיפוץ, במה שנראה אז לרבים כנסיון לי להעברה זוחלת בפועל של השליטה על הקבר לידים פלשתיניות.
הרב שמואל רבינוביץ' מסר אז לערוץ 7 כי השליטה על הקבר אינה מעניינו אלא החלטה בלבדית של המנהל האזרחי ופיקוד המרכז.
לאחר פרסום העניין התחוללה סערה גדולה ברחבי ארץ, ורבני השומרון, מועצה אזורית שומרון והארגונים היהודים הפועלים למען הקבר פעלו נמרצות והצליחו לעצור את המהלך, לא מעט בעקבות דבריו של הרב הראשי לישראל הרב יונה מצגר אשר הודיע כי יש להתיעץ עם רבני השומרון שקבר יוסף בשטחם לפני כל פעילות הקשורה למקום. ואכן, החלק העיקרי של השיפוץ נעשה ע"י יהודים בחול מועד סוכות.
יו"ר האיחוד הלאומי, ח"כ יעקב כץ (כצל'ה), קרא הערב לאישים הבכירים "לבטל את התוכנית לנסוע אל מושל הרשות החבלנית בשכם". כצל'ה מוחה נמרצות על כוונה זו ואומר כי "לא יהיה זה מכבודה של מדינת ישראל שרבניה וראשיה ילכו לפריץ מטעם המחבלים ערפאת ואבו-מאזן ויודו לו על השמירה על קברו של יוסף הצדיק".
גרעין שכם מסר כי "קבר יוסף עדיין נטוש ולאחר יותר מעשור הגיע העת לשוב לשכם. אנו דורשים מהרמטכ"ל ואלוף הפיקוד ומראש המנהל האזרחי להשיב את הנוכחות היהודית הקבועה לעיר שכם ולקבר יוסף, ולחדש את הישיבה במקום, כמו כן אנו דורשים מהרבנים הראשיים לא לתת יד להמשך ההפקרה של שכם וקבר יוסף".