בעקבות החלטת הממשלה תקציב הישיבות יגיע לשיא של כל הזמנים ויעמוד על 1.167 מיליארד שקלים. השיא הקודם נשבר רק לפני פחות מחצי שנה ביוני האחרון ועמד על 1.119 מילארד שקלים. קודם לכן השיא היה ב2011 ועמד על 1.032 מיליארד. תקציב הישיבות הוגדל מ-564 מיליון ב-2014 ל-984 מיליון בראשית 2016, תוספת של 74%. עם אישור התוספת החדשה יגדל תקציב הישיבות מתחילת 2014 ב107%, כלומר יותר מפי שתיים.
ההגדלה בתקציב הישיבות נובעת מהדרישה להעניק לתלמידי חו"ל הלומדים בישיבות בארץ, שיעור תמיכה גבוה יותר העומד על 95% משיעור התמיכה המלא בתלמידים תושבי הארץ, זאת במקום שיעור של 60% שהיה נהוג קודם לכן. שינוי נוסף שנעשה בהסדר זה הוא ביטול ההתניה שנקבעה בזמנו על ידי ממשלת ליכוד-לפיד לפיה תלמיד ישיבה מחו"ל הלומד בישראל יהיה זכאי לתמיכה בתנאי שישתתף בתכנית 'מורשת ישראל' של משרד החינוך.
יצוין כי תקציב הישיבות אינו כולל בתוכו את הבטחת ההכנסה לאברכים. תוספת זו צפויה לעלות לדיון בכנסת ביום רביעי הקרוב, ואם תאושר תוסיף עוד כ100 מיליון שקלים.
הנתונים מעוררים זעם בקרב אנשי עמותת חדו"ש לחופש דת ושוויון שמנכ"לה, הרבה הרפורמי אורי רגב, קובע כי "שוד הקופה הציבורית בשיטת הסלאמי נמשך. לדידם של הפוליטיקאים החרדים קופת משלמי המסים היא פרה חולבת למימון הציבור החרדי".
רגב מחריף את תגובתו ואומר כי "הפעם בולטת החוצפה במיוחד, שכן בממשלה הקודמת התנו את המשך מימון תלמידי הישיבות מחו"ל, שאינם אזרחי המדינה או תושביה ואינם שותפים לנטל האזרחי, בכך שיחשפו במהלך לימודיהם לתכנית שתפרוש בפניהם את ערכי ישראל כמדינה יהודית ודמוקרטית. אלה כמובן דברי כפירה בעיני גפני וחבריו. לפיכך ברגע שחזר לידיהם השוט על הממשלה הניפו אותו והעיפו את הדרישה הסבירה הזו, כדי שמימון המדינה יוכל להיות מוקדש להכשרה "טהורה" שאינה מבלבלת את מקבלי המימון באשר למשמעותה של מדינת ישראל. למרבה הצער, ברור שאין זאת החרפה הראשונה או האחרונה במסלול הכניעה של הפוליטיקאים מימין ומשמאל לתכתיבי הפוליטיקאים החרדים."