השפעת הפעילות של צה"ל על איכות הסביבה בישראל רחבה ומשמעותית משום פריסתה הגיאוגרפית הרחבה, אופיה והנגיעה שיש לה לחלקים גדולים מתושבים המדינה. לפעילות צה"ל יש פוטנציאל ממשי לפגיעה בסביבה ולזיהום האויר, הים, הקרקע והטבע באמצעות פסולת מוצקה ונוזלית, שפכים, חומרים מסוכנים, רעש וקרינה.
מבקר המדינה שם דגש במספר דו"חות לנושאי איכות הסביבה ודו"ח זה הוא השלמה למעשה של הדו"ח על איכות הסביבה בחברות תשתית האנרגיה.
ח"כ אמנון כהן, יו"ר הוועדה לענייני ביקורת המדינה, אמר כי נושא איכות הסביבה הוא נושא חשוב ביותר במדינה ודו"ח הביקורת העלה ממצאים חמורים ביותר. נראה כי צה"ל מתנהל כ"מדינה בתוך מדינה" ולא פועל על-פי הוראות החוק הקיים וכמעט כל פעילות הצבא בתחום החומרים המסוכנים מתבצעת ללא קבלת היתרים מהמשרד לאיכות הסביבה. צה"ל לא עמד בדרישות הנוגעות למשטחי תידלוק בניגוד לחוק הקיים משנת 1997. משרד הביטחון לא טיפל בשני זיהומים נרחבים: זיהום אקוויפר חצור והתחמושת בחוף תל אביב.
על-פי ממצאי מבקר המדינה נתגלו ליקויים רבים בטיפול צה"ל ומשרד הביטחון בנושא איכות הסביבה: נמצא כי חמש שנים לאחר שצה"ל גיבש מדיניות בנושא איכות הסביבה - טרם הונחו יסודות עיקריים הדרושים למימושה של המדיניות שנקבעה. בנוסף העלתה הביקורת כי המשרד לאיכות הסביבה לא קיים פיקוח כנדרש על איכות הסביבה בצה"ל. לא נקבעו מבחנים להבחנה בין פעילות צה"ל בתחום החומרים המסוכנים המחייבת קבלת היתר לבין אלה שלא. המבקר ציין כי למעלה מ-20 שנה נערכות בדיקות והערכות בנוגע להיקף הזיהום באקוויפר חצור - ולא נעשתה פעילות ממשית להסרת הזיהומים.
ראש אג"ת בצה"ל, האלוף הראל חאקי, אמר לוועדה כי צה"ל קיבל על עצמו, בסוף שנות ה-90 לפעול לשמירה על איכות הסביבה מתוך ראיה לאומית ובהתאם למגמות המתפתחות בתחום זה בישראל וביצע פעילויות רבות לקידום הטיפול בנושא.
לוועדה הוצגה מצגת המראה את תיקון הליקויים עליהם הצביע המבקר אך יחד עם זאת הדגיש האלוף חאקי כי "בתחום זה לא נגיע לעולם אל המנוחה והנחלה." בעיית התחמושת הפזורה בים התיכון היא בעיה קשה מאוד ועל מדינת ישראל להשקיע מיליארדים בסילוקה" והדגיש כי "כולנו באותו צד של המתרס וצה"ל הוא תבנית נוף מולדתו אנחנו לא ארגון פורעי חוק."
מבקר המדינה שם דגש במספר דו"חות לנושאי איכות הסביבה ודו"ח זה הוא השלמה למעשה של הדו"ח על איכות הסביבה בחברות תשתית האנרגיה.
ח"כ אמנון כהן, יו"ר הוועדה לענייני ביקורת המדינה, אמר כי נושא איכות הסביבה הוא נושא חשוב ביותר במדינה ודו"ח הביקורת העלה ממצאים חמורים ביותר. נראה כי צה"ל מתנהל כ"מדינה בתוך מדינה" ולא פועל על-פי הוראות החוק הקיים וכמעט כל פעילות הצבא בתחום החומרים המסוכנים מתבצעת ללא קבלת היתרים מהמשרד לאיכות הסביבה. צה"ל לא עמד בדרישות הנוגעות למשטחי תידלוק בניגוד לחוק הקיים משנת 1997. משרד הביטחון לא טיפל בשני זיהומים נרחבים: זיהום אקוויפר חצור והתחמושת בחוף תל אביב.
על-פי ממצאי מבקר המדינה נתגלו ליקויים רבים בטיפול צה"ל ומשרד הביטחון בנושא איכות הסביבה: נמצא כי חמש שנים לאחר שצה"ל גיבש מדיניות בנושא איכות הסביבה - טרם הונחו יסודות עיקריים הדרושים למימושה של המדיניות שנקבעה. בנוסף העלתה הביקורת כי המשרד לאיכות הסביבה לא קיים פיקוח כנדרש על איכות הסביבה בצה"ל. לא נקבעו מבחנים להבחנה בין פעילות צה"ל בתחום החומרים המסוכנים המחייבת קבלת היתר לבין אלה שלא. המבקר ציין כי למעלה מ-20 שנה נערכות בדיקות והערכות בנוגע להיקף הזיהום באקוויפר חצור - ולא נעשתה פעילות ממשית להסרת הזיהומים.
ראש אג"ת בצה"ל, האלוף הראל חאקי, אמר לוועדה כי צה"ל קיבל על עצמו, בסוף שנות ה-90 לפעול לשמירה על איכות הסביבה מתוך ראיה לאומית ובהתאם למגמות המתפתחות בתחום זה בישראל וביצע פעילויות רבות לקידום הטיפול בנושא.
לוועדה הוצגה מצגת המראה את תיקון הליקויים עליהם הצביע המבקר אך יחד עם זאת הדגיש האלוף חאקי כי "בתחום זה לא נגיע לעולם אל המנוחה והנחלה." בעיית התחמושת הפזורה בים התיכון היא בעיה קשה מאוד ועל מדינת ישראל להשקיע מיליארדים בסילוקה" והדגיש כי "כולנו באותו צד של המתרס וצה"ל הוא תבנית נוף מולדתו אנחנו לא ארגון פורעי חוק."