בכתב האישום שהוגש בבית המשפט המחוזי בירושלים נטען כי חוויס, אשר עבד בחנות ירקות הסמוכה לבית הרב יוסף, ומחבל נוסף מן החזית העממית לשחרור פלסטין החלו בתכנון ההתנקשות ברב לפני כארבעה חודשים. השניים ערכו סיור מקדים לבדיקת סידורי האבטחה סביב בית הרב ואף ניסו לרכוש תחמושת לצורך ביצוע ההתנקשות.

יש לציין כי שלב תכנון ההתנקשות על ידי השנים הסתיים לאחר שהצליחו לאסוף את כל החומר שנדרשו. מעצרם על ידי השב"כ נעשה בזמן שחיכו להוראות מן הבכירים בחזית העממית בדבר אופן ביצוע ההתנקשות.

חוליית החזית העממית אליה השתייכו השנים שייכת לפלג המזרח-ירושלמי של החזית העממית, ממנו יצאו רוצחיו של השר רחבעם זאבי ז"ל. על פי הפירסום בגלי צה"ל, קיבלו חברי החולייה את "ברכת הדרך" ממנהיגי הפלג, שכלואים בשכם.

הרב עובדיה יוסף לא צפוי לבטל את שיעוריו הפומביים או לשנות את לוח הזמנים שלו בעקבות לכידת המתנקש.