התיאום הביטחוני בין ישראל לרש"פ נמשך וקציני צה"ל מקיימים קשר כרגיל עם מקביליהם במנגנוני הביטחון הפלשתיניים. זאת, בניגוד להכרזת ממלא מקום ראש הממשלה, אהוד אולמרט, בישיבת הממשלה שלשום כי "הרש"פ הפכה הלכה למעשה לרשות טרוריסטית".

הדברים נאמרו בעקבות השבעת הפרלמנט החדש ברמאללה, המורכב ברובו מהחמאס. אולמרט אף אמר כי "ישראל לא תנהל מגעים עם שלטון שהחמאס הוא חלק ממנו: קטן, גדול או קובע".

ממשלת ישראל החליטה על הפסקת העברת כספי המסים לרש"פ; איסור מוחלט של כניסת פועלים מרצועת עזה לישראל; איסור על מעבר של ערבים בין רצועת עזה ליהודה ושומרון, למעט מקרים הומניטריים; והקפאת פרויקטים כגון הקמת נמל תעופה ונמל ימי ברצועה. מופז הורה שלא לפגוע באפיקים הומניטריים, ולא להגביל את אספקת החשמל, המים והציוד הרפואי.

ישראל גם החליטה למנוע את כניסתם של ג'יפים, קומנדקרים, מכשירי קשר ושריוניות, שמדינות שונות מבקשות לתרום לרש"פ.