תקציב המדינה לשנת 2007 אושר בממשלה ברוב של 19 תומכים מול 4 מתנגדים. שרי ש"ס התנגדו להצעה ואילו יושב ראש העבודה, עמיר פרץ, נמנע בהצבעה. הימנעותו של פרץ התבצעה למעשה בהיעדרותו מתחילת ההצבעה. פרץ היה הערב בטקס אזכרה לחללי חטיבת גבעתי וכשהגיע לישיבה, לקראת סופה, שאל ראש הממשלה את שר הביטחון האם הוא מעוניין להצביע העדיף פרץ שלא לעשות זאת.
אחר הצהרים התכנסו שרי מפלגת העבודה לישיבה בה הוחלט כי אם לא יועלה שכר המינימום בתקציב 2007 תצביע מפלגת העבודה נגד ההצעה. את המהלך מוביל יו"ר העבודה, שר הביטחון, עמיר פרץ. מאוחר יותר, לאחר דיונים קדחתניים, נודע כי רוב שרי העבודה התרצו ומסכימים לאשר את התקציב אך יו"ר המפלגה נותר איתן בסירובו לאשר את התקציב בממשלה. אחד משרי העבודה אף צוטט כאומר שעמיר פרץ מוביל את הקו שלו על דעת עצמו בלבד. בין פרץ לראש הממשלה נערכה פגישה בניסיון לפתור את המשבר אך היא הסתיימה ללא תוצאות.
כאמור, בעת ההצבעה התנגדו ארבעה שרים בלבד להצעת התקציב ושר הביטחון, עמיר פרץ, נמנע.
אישור התקציב גרר אחריו תגובות רבות מכל קצווי המערכת הפוליטית. חבר הכנסת יורם מרציאנו מן העבודה אמר בעקבות תמיכת שרי מפלגתו בהצעת התקציב כי המפלגה מאבדת את הדגל שלה, שהיה שכר המינימום, ולא מכבדת את המילה שלה. "זהו המשך הדרדרותה הפוליטית של מפלגת העבודה. אפשר לשבור את הראש, אבל לא את המילה. בסוף, התקציב יגיע לכנסת, ואז צריך אותנו, את חברי הכנסת, ולא יהיה להם אותנו", אמר.
לעומתו, המשנה לראש הממשלה, שמעון פרס, בירך על הצבעת שרי הממשלה להעביר את תקציב המדינה, ובראש ובראשונה ציין פרס את העובדה ש- 150 מיליון ש"ח יועברו ישירות לפיתוח הנגב, וליישום התוכנית האסטרגטית לפיתוח הנגב. הכסף יהיה תחת אחריותו של משרד המשנה לראש הממשלה.
לדברי פרס, זהו צעד ראשון וחשוב להחזרת האמון של תושבי הנגב ורצינות כוונותיה של ממשלת ישראל, לחזק ולפתח את הנגב. פרס אמר כי משרדו מתכוון להגדיל משמעותית סכום זה על ידי איגום משאבים ממשרדי הממשלה, וגיוס תרומות מארגונים היהודים, קרנות, אנשי עסקים וחברות המבקשים להשקיע בנגב.