הפרופסור רפי ישראלי מהאוניברסיטה העברית בירושלים מבאר ביומן הצהרים של ערוץ 7 את התלהטות העולם המוסלמי סביב התבטאות האפיפיור למרות שדתות אחרות ספגו פגיעות דומות ואף חמורות יותר במניעים היסטוריים.
לדבריו העובדה שהעולם המוסלמי הוביל בעבר את התרבות בעולם כעולו וכעת הוא מצוי בתחתית המדרגה בציוויליזציה מביאה את העולם המוסלמי להגיב באלימות. זאת בעיקר לנוכח הציפייה שהייתה לעולם המוסלמי לעתיד שבו ישלטו בעולם כולו והמציאות המוכיחה התרחקות מתקווה זו.
לכך מוסיף פרופסור ישראלי את היסח אותו מטילים המוסלמים כמעט באופן אוטומטי ליהודים כקשר קונספירטיבי. גם עובדה זו מתסיסה את האיסלאם.
באשר להתנצלותו החלקית של האפיפיור אומר ישראלי כי מדובר בהתנצלות מוגבלת מאוד שכן הוא רק הבהיר שמדובר בציטטה מתוך דברי גורם אחר אך המוסלמים לא יבליגו עד שיראו אותו כורע ברך בפני מי שהם רואים כנזר הבריאה – מוחמד. "האפיפיור אמר את התנצלותו לא כי חשוב לו מה יחשבו המוסלמים, הרי גם כשהיה בישוף התבטא בחריפות נגד האיסלאם. את דבריו הוא אמר רק כי הוא חושש לגורלם של המיעוטים הנוצריים במדינות מוסלמיות".
להערכתו של ישראלי האפיפיור הוצרך לדברים בעיקר לנוכח המציאות בה אחוזים רבים מהציבור האירופי מתאסלם, ובעיקר בצרפת. האפיפיור מנסה להוכיח לעולם המתאסלם שהתרבות הנוצרית ראויה מול העבר והתרבות המוסלמית שאינה כפי שהיא מצוירת על ידי נציגי האיסלאם.
בימים אלה חתם פרופ' ישראלי את כתיבתו של ספר המגולל את השתלבותו של האיסלאם באירופה, ולדבריו העימות מצוי בעיצומו, ובעתיד צפוי העימות הזה להתגבר.