התנועה לאיכות השלטון מותחת ביקורת על התנהלות ועדת וינוגרד. במכתב ליועהמ"ש מזוז מבקשת התנועה "להנחות" את חברי הועדה להצמד לנוהלי עבודה ברורים ואחידים עם כל נבדקיה תוך קיום פרוטוקול ומפגשים במקום מושבה היא.



התנועה מתייחסת לפרסומים לפיהם ביום חמישי האחרון נפגשה וועדת הבדיקה הממשלתית, בראשותו של השופט (בדימוס) אליהו וינוגרד, עם ראש הממשלה ושר הביטחון. אולם, "במקום שיגיעו נבדקים אלה אל הגוף הבודק במקום מושבו הרשמי, הגיע הגוף הבודק אל הנבדקים - בלשכותיהם, וזאת תוך קיום דיון בלא פרוטוקול".



יש במהלך זה משום "מראית עין בעייתית ביותר, לפיה ראש הממשלה ושר הביטחון מקבלים יחס מועדף מוועדת הבדיקה", כותבת התנועה. "טעם לפגם זה מתחזק בפרט היות ומדובר באותם גורמים אשר מינו את חברי וועדת הבדיקה, ומכאן שמהלך שכזה ויחס מועדף דווקא כלפיהם, פוגע באמון שייתן הציבור במסקנות הוועדה בכלל, ובכל הנוגע לשניים אלה - בפרט". על כך יש להוסיף כי "נראה שיש בכך משום פגיעה בשוויון הנדרש כלפי הנבדקים, מקום בו דווקא נבדקים אלה מקבלים יחס שונה ומועדף על פני מאות הנבדקים האחרים שצפויים להגיע בפני הוועדה, ולא הוועדה בפניהם. כך גם מנוגד הדבר לחובת הוועדה לקיים את דיוניה באופן העולה בקנה אחד עם עקרון השקיפות ועם זכות הציבור לדעת".



התנועה גם ביקשה ממזוז להתייחס למינויו כמזכיר הועדה של מני בן חיים אשר כיהן בתקופת מערכת הבחירות האחרונה כפעיל מרכזי במטה הבחירות של קדימה "אם אכן יש אמת בפרסום, מדובר במינוי בעייתי ביותר היוצר ניגוד עניינים מובנה, שבעטיו יש לפסול את מר בן חיים מלכהן בתפקיד מזכיר הוועדה. שכן, אדם שהיה פעיל פוליטי למען מפלגת קדימה והעומדים בראשה, לא יכול היום לכהן בתפקיד רגיש ועדין כל כך בוועדה שאמורה לבדוק, בין היתר, את התנהלותם של אותם האנשים למענם הוא פעל".