ראשיתה של הפרשה באמצע שנות התשעים, עת ביצעה הכנסייה בראשותו של הפטריארך דיאודורוס עסקת נדל"ן עם חברת הבניה 'אלקונטרן'. ממניעיהם שלהם מנעו מספר בכירים במחלקת הכספים של הכנסייה מהפטריארך להשלים את הליך החתימה המתחייב מצידו על מסמכי העסקה, וזו לא באה לכדי השלמה.
בשלב מאוחר יותר רכשה חברת הנדל"ן 'סידרון' בבעלות איש העסקים יורם עזרי, את זכויותיה של 'אלקונטרן' במיזם הבניה, וביקשה לפנות לערכאות בתביעה נגד הכנסייה על מנת שזו תממש את העסקה עליה הוחלט.
כבורר בין שני הצדדים הוסכם השופט בדימוס מאיר שמגר, שבתום דיון ארוך החליט כי על הכנסייה היוונית לשלם לחברת הבניה סכום של 25 מיליון שקלים.
במהלך כל שנות כהונתו של הפטריארך הקודם, אירינאוס הראשון, לא שולם ולו שקל אחד לחברת הבניה, והחוב הלך ותפח עד שהגיע לכדי כארבעים וחמישה מיליון שקלים.
לאחר הדחת אירינאוס מכהונת הפטריארך, החל הפטריארך החדש, טיאופילוס השלישי, בהליכים להסדרת החוב שהעיק על קופתה של הכנסייה והמשיך לצבור ריביות. במהלך ששת החודשים הראשונים לבחירתו הצליח טיאופילוס להעביר לידי אנשי 'סידרון' סכום של 25 מיליון שקלים.
לפרשת החוב שכאמור, הלך ותפח, נכנסו גורמים בכירים בממשל היווני. שרת החוץ היוונית, דורה בקויאניס, וסגנה, קציניס, נכנסו לעובי הקורה ולאחר החלטה שאותה העבירה ביוון, העבירה השרה לכנסייה מענק מיוחד בגובה של ארבעה מיליון יורו על מנת לכסות את חובה של הכנסייה. ביום חמישי האחרון העבירו אנשי הכספים של הכנסייה ל'סידרון' סכום הקרוב לעשרים מיליון שקלים ובכך השלימה את תשלום חובה.
מהכנסייה נמסר כי שם רואים בצער את סירובה של ממשלת ישראל להכיר בפטריארך הנוכחי כפטירארך לכל דבר. לדבריהם, לולי הייתה נוקטת ישראל במדיניות זו היה יכול טיאופילוס לבצע עסקאות ברשויות הישראליות ובכך לבצע את תשלום החוב מבלי להזדקק לסיוע מן החוץ.
בשלב מאוחר יותר רכשה חברת הנדל"ן 'סידרון' בבעלות איש העסקים יורם עזרי, את זכויותיה של 'אלקונטרן' במיזם הבניה, וביקשה לפנות לערכאות בתביעה נגד הכנסייה על מנת שזו תממש את העסקה עליה הוחלט.
כבורר בין שני הצדדים הוסכם השופט בדימוס מאיר שמגר, שבתום דיון ארוך החליט כי על הכנסייה היוונית לשלם לחברת הבניה סכום של 25 מיליון שקלים.
במהלך כל שנות כהונתו של הפטריארך הקודם, אירינאוס הראשון, לא שולם ולו שקל אחד לחברת הבניה, והחוב הלך ותפח עד שהגיע לכדי כארבעים וחמישה מיליון שקלים.
לאחר הדחת אירינאוס מכהונת הפטריארך, החל הפטריארך החדש, טיאופילוס השלישי, בהליכים להסדרת החוב שהעיק על קופתה של הכנסייה והמשיך לצבור ריביות. במהלך ששת החודשים הראשונים לבחירתו הצליח טיאופילוס להעביר לידי אנשי 'סידרון' סכום של 25 מיליון שקלים.
לפרשת החוב שכאמור, הלך ותפח, נכנסו גורמים בכירים בממשל היווני. שרת החוץ היוונית, דורה בקויאניס, וסגנה, קציניס, נכנסו לעובי הקורה ולאחר החלטה שאותה העבירה ביוון, העבירה השרה לכנסייה מענק מיוחד בגובה של ארבעה מיליון יורו על מנת לכסות את חובה של הכנסייה. ביום חמישי האחרון העבירו אנשי הכספים של הכנסייה ל'סידרון' סכום הקרוב לעשרים מיליון שקלים ובכך השלימה את תשלום חובה.
מהכנסייה נמסר כי שם רואים בצער את סירובה של ממשלת ישראל להכיר בפטריארך הנוכחי כפטירארך לכל דבר. לדבריהם, לולי הייתה נוקטת ישראל במדיניות זו היה יכול טיאופילוס לבצע עסקאות ברשויות הישראליות ובכך לבצע את תשלום החוב מבלי להזדקק לסיוע מן החוץ.