עימות גלוי היום בין עמדת משרד הביטחון ומשרד האוצר לגבי תקציב הביטחון לשנת 2007. עימות ראשון היה בעצם קיומו של הדיון על חלק מתקציב הביטחון – בסך 11 מיליארד ₪ - בישיבת ועדת הכספים ולא, כמקובל בכנסת מאז הוקמה, בישיבת הועדה המשותפת לתקציב הביטחון.
יו"ר ועדת הכספים, ח"כ יעקב ליצמן, החליט לראשונה בתולדות הכנסת לקיים דיון בחלק הגלוי של תקציב הביטחון עקב קרע עם יו"ר ועדת חוץ וביטחון, ח"כ צחי הנגבי. כל נסיונות הפשרה בין שני היו"רים עלו בתוהו. זאת, לאחר שח"כ ליצמן הסתמך על תקנון הכנסת, הקובע שיו"ר הועדה המשותפת יהיה נציג ועדת הכספים ואילו ח"כ הנגבי החליט להתעלם מכך, משיקולים קואליציוניים.
בהופעתו של שר הביטחון, לראשונה על תקציב משרד הביטחון בועדת הכספים, הוא אף התייחס לכך וקבע: "ההחלטה לקיים דיון בועדת הכספים, בחלק הגלוי של תקציב הביטחון – היא החלטה נכונה", קבע השר פרץ והוסיף, "זו תפקידה של הכנסת לבדוק את תקציב מערכת הביטחון ואני תומך בעמדתו של יו"ר ועדת הכספים".
יו"ר הועדה, ח"כ ליצמן, הודיע בתום סקירת שר הביטחון, כי בניגוד לעמדתה של היועצת המשפטית של הכנסת, עו"ד נורית אלשטיין, הוא יעמיד להצבעה בועדת הכספים את תקציב משרד הביטחון, בנושאים הלא מסווגים, כיון שהוא סבור כי כפי שהועדה יכולה לדון בנושא, היא גם אמורה להצביע עליו. שוב, היה זה עימות בין עמדות יו"ר הועדה לבין עמדת היועצת המשפטית בכנסת.
שר הביטחון, עמיר פרץ, חזר על דרישתו להגדיל את הגרעון בתקציב המדינה משיעור של 1% כפי החוק כיום לשיעור גדול יותר של 1.7%, כדי שניתן יהיה להמציא את תוספת המימון הנחוץ למערכת הביטחון, בשיעור של 2 מיליארד ₪, ושעדיין לא נמצא לה מקור תקציבי. "אחרת, אם לא תהיה תוספת תקציבית, כפי שדורש משרד הביטחון בתקציב 2007, נצטרך לצמצם את היקף הסד"כ (סדרי כוחות) של צה"ל", הודיע שר הביטחון. מנגד, הצהיר מייד לאחר מכן, בתגובה, סגן הממונה על התקציבים במשרד האוצר, הראל בלינדה, כי לדעת האוצר "ניתן להוריד ולצמצם את ההוצאה בסעיפי תקציב הביטחון ועדיין להיות ערוכים מספיק לקראת המלחמה הבאה".
יו"ר ועדת הכספים, ח"כ יעקב ליצמן, החליט לראשונה בתולדות הכנסת לקיים דיון בחלק הגלוי של תקציב הביטחון עקב קרע עם יו"ר ועדת חוץ וביטחון, ח"כ צחי הנגבי. כל נסיונות הפשרה בין שני היו"רים עלו בתוהו. זאת, לאחר שח"כ ליצמן הסתמך על תקנון הכנסת, הקובע שיו"ר הועדה המשותפת יהיה נציג ועדת הכספים ואילו ח"כ הנגבי החליט להתעלם מכך, משיקולים קואליציוניים.
בהופעתו של שר הביטחון, לראשונה על תקציב משרד הביטחון בועדת הכספים, הוא אף התייחס לכך וקבע: "ההחלטה לקיים דיון בועדת הכספים, בחלק הגלוי של תקציב הביטחון – היא החלטה נכונה", קבע השר פרץ והוסיף, "זו תפקידה של הכנסת לבדוק את תקציב מערכת הביטחון ואני תומך בעמדתו של יו"ר ועדת הכספים".
יו"ר הועדה, ח"כ ליצמן, הודיע בתום סקירת שר הביטחון, כי בניגוד לעמדתה של היועצת המשפטית של הכנסת, עו"ד נורית אלשטיין, הוא יעמיד להצבעה בועדת הכספים את תקציב משרד הביטחון, בנושאים הלא מסווגים, כיון שהוא סבור כי כפי שהועדה יכולה לדון בנושא, היא גם אמורה להצביע עליו. שוב, היה זה עימות בין עמדות יו"ר הועדה לבין עמדת היועצת המשפטית בכנסת.
שר הביטחון, עמיר פרץ, חזר על דרישתו להגדיל את הגרעון בתקציב המדינה משיעור של 1% כפי החוק כיום לשיעור גדול יותר של 1.7%, כדי שניתן יהיה להמציא את תוספת המימון הנחוץ למערכת הביטחון, בשיעור של 2 מיליארד ₪, ושעדיין לא נמצא לה מקור תקציבי. "אחרת, אם לא תהיה תוספת תקציבית, כפי שדורש משרד הביטחון בתקציב 2007, נצטרך לצמצם את היקף הסד"כ (סדרי כוחות) של צה"ל", הודיע שר הביטחון. מנגד, הצהיר מייד לאחר מכן, בתגובה, סגן הממונה על התקציבים במשרד האוצר, הראל בלינדה, כי לדעת האוצר "ניתן להוריד ולצמצם את ההוצאה בסעיפי תקציב הביטחון ועדיין להיות ערוכים מספיק לקראת המלחמה הבאה".