הרמטכ"ל, דן חלוץ, החליט אמש לקבל את ההמלצות האישיות, המופיעות בדו"ח האלוף דורון אלמוג בנושא אירוע חטיפת החיילים, ועל פיהן צריך תא"ל גל הירש, מפקד עוצבת הגליל, לעזוב את תפקידו.
החלטת הרמטכ"ל באה לאחר שערך שימוע להירש, על אף שזה התפטר כבר מצה"ל בעקבות פרסום המסקנות.
מפקד אוגדת הגליל תת אלוף גל הירש הגיש לפני למעלה מחודש את התפטרותו לרמטכ"ל חלוץ בעקבות דו"ח קשה של האלוף במילואים דורון אלמוג על חטיפת החיילים רגב וגולדווסר והריגתם של שמונה חיילים.
עיקר הטענות כלפי תת אלוף הירש הן בפער בין תכנון נכון לבין ישומו הלקוי בדרגים שמתחתיו ובכך שלא טרח לוודא שהנחיותיו מבוצעות. גדוד המילואים של גולדווסר ורגב לא תירגל כנדרש תרחיש של חטיפה עם כניסתו לגיזרה.
באחד בדצמבר 2006 נערך הליך פיקודי של שימוע למפקד האוגדה, תת-אלוף גל הירש, במסגרתו ניתנה לתת-אלוף הירש האפשרות להשמיע את גרסתו בנוגע לאירוע החטיפה, למוכנות ולכשירות האוגדה עליה פיקד בהקשר זה. השימוע נערך בפני הרמטכ"ל, לאור המחויבות הפיקודית והמשפטית לתת הזדמנות לכל קצין להשמיע את עמדתו בטרם יתקבלו לגביו החלטות פיקודיות העלולות לפגוע בהמשך קידומו או בשמו הטוב. הרמטכ"ל בחר לקיים את השימוע בנוכחות מספר אלופים על מנת שיוכל לשמוע גם את עמדתם בטרם יגבש דעתו בעניין.
הרמטכ"ל קיבל חלק מן הדברים שהועלו על ידי תת-אלוף הירש, ואלה עיקריהם:
כשל טקטי בודד כשלעצמו לא צריך להוות, בהכרח, בסיס להסקת מסקנות אישיות כנגד מפקדים; הרמטכ"ל ציין לחיוב הן את פיתוח תפיסת ההגנה על ידי תת-אלוף הירש והן את פעולותיו בניסיון לשפר את המענה הטכנולוגי לסיכונים בגזרתו.
עם זאת, הרמטכ"ל מוצא שהכשל הפיקודי העיקרי כפי שהוא עולה גם מדו"ח אלמוג נגע לאי נקיטת המהלכים הפיקודיים הנדרשים לאורך זמן, לאור התובנה של תת-אלוף הירש כי התפקוד המבצעי של הגדוד אינו מניח את הדעת. הרמטכ"ל סבור, כי פתרון בעיות מסוג זה לא יכול להיות בדרך של החלפתן של יחידות. האתגר הפיקודי והמנהיגותי האמיתי הינו להחזיר את היחידות לתפקוד מבצעי תקין. במקביל, הדבר מחייב ניתוח קונקרטי של נקודות התורפה והסיכונים לאור טיב השגרה המבצעית בגדוד.
הרמטכ"ל סבור שתת-אלוף הירש הוא קצין בעל יכולות טובות מאוד, ומדגיש כי לא מדובר בכישלון ערכי. לאור יכולותיו אלה מחד, ולאור הכשל הפיקודי שבהובלת הגדוד לתפקוד מקצועי באופן שמיישם את התובנות העולות מן הצורך המבצעי, והפער שנתגלה בין התפיסה לביצועה בשטח. מאידך- ככלל, הרמטכ"ל קיבל את המלצת הצוות ביחס לתת-אלוף הירש, בתוך כך המלצת הצוות לפיה תת-אלוף הירש מתאים לתפקיד מטה ולא לתפקידי פיקוד, הדבר עולה בקנה אחד עם החלטת הרמטכ"ל למנותו לתפקיד המטה של ראש חטיבת אסטרטגיה באגף התכנון. יחד עם זאת, משבחר תת-אלוף הירש להשתחרר מצה"ל - נושא זה אינו עומד עוד על הפרק.
במכתבו לחלוץ כתב הירש: "אני סבור כי אוגדה 91 הכינה עצמה היטב למלחמה, עסקה באופן רצוף ומקצועי בנסיונות למניעת חטיפה ומשפרצה המלחמה פעלה ברציפות 34 יום, בהגנה ובהתקפה בהיקף כוחות גדול. תוצאות אירוע החטיפה קשה, המלחמה תמה וימים יגידו את הישגיה אך אני יכול וגאה לקבוע כי מצאתי בכוחות הלוחמים תחת פיקודי עוז רוח, כשרון וערכים המצויים בדור הזה כבדורות הלוחמים בעבר (ואף יותר).
אני סבור שהצבתה של אוגדה או אוגדות במוקד תחקור הלחימה היא שגיאה קשה. אני כואב את הצבתם של מפקדי האוגדות באופן לא ראוי בפני הציבור - לא נכון לנהוג כך במצביאיו של עם ישראל.
מתחילת המלחמה אני מוצא עצמי חשוף להעדר גיבוי, להשמצות ולפגיעה הולכת ומתעצמת בשמי הטוב. משפחתי, חברי ואני עוברים ימים קשים כבר חודשים ארוכים ואיני מוצא לכך הצדקה. לא נכון לנהוג כך במפקד-לוחם. מגיל 14 אני לובש מדים, דרך ארוכה עברתי כלוחם ומפקד בכל גזרות הלחימה של צה"ל. נפצעתי פעמיים וחזרתי לשירות, צה"ל ומדינת ישראל הם תמצית חיי.
לפני שבוע הודיעני האלוף (מיל') אלמוג את המלצתו הצפויה, אמש הועבר לעיוני הדו"ח. משנורה החץ וננעץ, ציור המטרה אינו משנה והוא בעיני חסר. אני מוצא כי תחקיר אירוע החטיפה בוצע כמוכוון מטרה ואג'נדה. ההקשרים בו רופפים וחסרים ואף שיש בו מסקנות מספר עימן אני מסכים הרי שתמציתו, דרך ניתוחו ופרטים מהותיים בו אינם מקובלים עלי, לצערי, מהיכרות עם התהליך איני סבור כי אוכל להשפיע עליו מהותית וממילא נפל הפור והדין נחרץ, כזה או כזה.
אני סבור שנכון יהיה לקבוע כי אחריות ממשית לשגיאות, תקלות וכשלים נמצאת לא רק ביחידות הקצה ובמפקדיהן, יש ואחריות זו נכון שתילקח ממש ע"י דרגים בכירים. אני מבקש כי לא תפגע בדרגי הפיקוד והמטה שמתחתי בהחלטותיך. הם קצינים אמיצי לב ואנשים טובים ונכון שיוסיפו לשרת בצה"ל, המח"ט אל"מ חן לבני, קמ"ן האוגדה סא"ל א' ומג"די המילואים סא"ל (מי"ל) שגיא שדמי וסא"ל (מי"ל) בני עזרן הם מיטב בניה של הארץ הזו.
אני מעריך אותם את פקודי מאד, הם לי מקור כח ואמונה ואני אוהב אותם אהבת נפש. אני מפציר בך ובשר הבטחון לחדול מעינוי הדין ולאשר את מינוייהם של עמיתי מפקדי האוגדות".
במסגרת המינויים שהוצעו, צפוי היה תא"ל גל הירש, מפקד אוגדה 91, להתמנות לראש חטיבת תכנון אסטרטגי באגף התכנון ומפקד אוגדה 162, תא"ל גיא צור, ימונה למפקד המרכז הלאומי לאימוני יבשה. השניים, בנוסף לקצינים אחרים שהומלץ על קידום, ספגו ביקורת קשה על תפקודם והתנהלותם במלחמה.