מומחה לעניני ערבים, ח"כ לשעבר עו"ד אמנון לין, אומר כי מאחורי המהומות בשער המוגרבים עומד נסיון להתסיס את העולם המוסלמי תוך ניצול 'קדושת' מסגד אל אקצה. המהומות וההתבטאויות של הנהגת הערבים הן לדברי לין, בראיון לערוץ 7, 'צביעות ממדרגה ראשונה' ,שכן לערבים ידוע כי אין בכוונת ישראל לפגוע במסגד אל אקצה.
לין, בעבר מנהל המחלקה הערבית במפלגת העבודה ובהסתדרות בצפון, מוסיף כי מאחורי המהומות עומדים יו"ר התנועה האיסלאמית שייח ראאד סאלח וחבריו, "הרואים במסגד את אחד המנופים להסתה ולהגדלת מעמדם והשפעתם ברחוב הערבי ישראלי".
עם זאת, לין מותח ביקורת על עיתוי שיפוץ הגשר בשער המוגרבים. "מדוע דוקא עכשיו שהחמאס והפתח נמצאים בכינוס במכה עם המלך הסעודי עבדאללה? זה הרי מאפשר להפוך את ענין השיפוצים כפעולה שישראל עושה כדי לשבש את הכינוס". ישראל לדעתו היתה צריכה לקחת זאת בחשבון ולהיות מודעת לאפשרות שפעולה כזו יכולה לשמש מנוף ליצירת 'רעש גדול' בעולם המוסלמי.
אצבע מאשימה על התבטאויות של ערבים כמו זו של חבר הכנסת טאלב א-סנע, אשר שאל: למה אתם מתקנים שביל? מה לכם ולהר הבית?יש להפנות לדבריו למדינת ישראל. זו נכשלה לדעתו מאז מלחמת ששת הימים בשכנוע וביצירת עובדות בקשר של מדינת ישראל להר הבית.
לין סבור כי סוגיית הר הבית, סוגיה פוליטית מדינית, היא רק חלק ממלחמת תרבויות שכבר מתנהלת באזור בין תרבות האיסלאם לתרבות המערב. מדובר לדבריו במלחמת עולם שלישית אותה צפה פרופ' הטינגטון. במאמרו צפה הטינגטון כי מלחמת תרבויות זו תהיה "החריפה והגדולה ביותר". לין מוסיף כי לפני כמה ימים הצהיר ראש המוסד לשעבר אפרים הלוי ש"מלחמת העולם השלישית, מלחמת התרבויות כבר בעיצומה".