מבקר המדינה שלח אמש (א') מכתב תגובה למתקפת ראש הממשלה נגדו. "ראש הממשלה זורה חול בעיני הציבור", כתב. "זו אינה פעם ראשונה שראש הממשלה נוקט בסחבת ובזלזול כלפי מוסד הביקורת וכלפי המבקרים המקצועיים הפועלים מטעמו, בהתייחס לביקורת המופנית אליו. חבל שראש הממשלה מעלה טענות והאשמות שווא שאין להן כל יסוד במציאות, מנסה לזרות חול בעיניי הציבור ובמקום להתייחס לגופם של דברים הוא מתייחס לגופם של המבקרים. חבל גם שראש הממשלה חרג מגבולות הממלכתיות של תפקידו והעביר את הנושא לפסים אישיים. מבקר המדינה יופיע, כפי שהוזמן, בפני הוועדה לענייני ביקורת המדינה של הכנסת ושם ישמיע את דברו".
כזכור, תקף ראש הממשלה, אהוד אולמרט, במכתב חריף וחסר תקדים את מבקר המדינה, מיכה לינדנשטראוס. במכתב ליושב ראש הכנסת וליושב ראש הוועדה לביקורת המדינה, האשים אולמרט את לינדנשטראוס כי חשף את תוכן הדו"ח בפני העיתונאים לפני שהציג אותו למבוקרים, "אני מבליג מזה חודשים על ההדלפות ממשרד המבקר...נושאים רבים מודלפים לעיתונאים, שמודים בכך בפומבי. גם במקרה זה חשף המבקר את הדו"ח לפני עיתונאים בטרם הועבר לגורמים המבוקרים".
ראש הממשלה הוסיף "לצערי בדו"ח קובע המבקר שיא חדש של ציניות, הפרת נהלים בוטה ושיבוש יסודי של עבודת הביקורת, פרסום דו"ח לפני העברתו לגורמים המבוקרים הוא עברה פלילית והמשטרה צריכה לקבל הבהרות בעניין".
מפקד פיקוד העורף, האלוף יצחק גרשון, שלח מכתב חריף ליועצת המשפטית לכנסת וליועץ המשפטי של מבקר המדינה, בדרישה לבטל את הדיון ביום שלישי. האלוף גרשון מאיים כי בכוונתו לפנות בנושא לבג"ץ, אם לא תיענה דרישתו.
ח"כ אריה אלדד (האיחוד הלאומי) אומר כי דרישתו של מפקד פיקוד העורף לבטל את פרסום דו"ח מבקר המדינה היא שערורייתית ומבטאת ניסיון לסתימת פיות מערכת הביקורת על מחדלי המלחמה, כלשונו. "מי שנכשל בטיפול בעורף עוסק בחסימת הביקורת
במקום בטיפול בליקויים", אמר אלדד.
יו"ר הועדה לביקורת המדינה, ח"כ זבולון אורלב, התייחס להודעה על עתירה לבג"צ בדרישה לבטל את ישיבת הוועדה ביום ג', ואמר כי הוא מביע צער על כך שבעלי תפקידים החליטו להעדיף את האינטרסים האישיים ואת שמירת תפקידם ומעמדם על פני הצורך להפיק לקחים מהמחדלים והכשלונות בטיפול בעורף בזמן המלחמה, כלשונו. "אני נחוש בדעתי לקיים את ישיבת הוועדה במועדה, עפ"י סעיף 6 א' לחוק מבקר המדינה".
בסוף השבוע דווח כי ראש הממשלה, אהוד אולמרט, סירב להופיע בפני לינדנשטראוס על מנת למסור עדות על הטיפול בעורף במהלך המלחמה. בלשכת ראש הממשלה הודיעו כי תוך חודש יעבירו למבקר המדינה את תגובתם לדו"ח שבוחן את הטיפול בעורף במלחמת לבנון השנייה. ביום שלישי מתכוון המבקר, מיכה לינדנשטראוס, להגיש לכנסת את הדוח שגיבש - ללא תגובת ראש הממשלה, אהוד אולמרט.
במשרד מבקר המדינה אומרים כי ב-25 בדצמבר 2006 פנה המבקר בכתב לראש הממשלה בבקשה להיוועד עמו בנושא. לדברי מקורביו של לינדנשטראוס, ב-7 בינואר הודיע אולמרט כי אין בכוונתו להיפגש עם המבקר, והציע להשיב על קובץ שאלות שיועבר אליו בכתב.