גורמים ערביים מתעקשים כי המחבל עלאא' אבו דהים, שביצע את הפיגוע הרצחני בישיבת מרכז-הרב ביום חמישי, פעל בשליחות חיזבאללה, כנקמה על רצח מורנייה.
מקורות פלשתיניים טוענים כי שעות ספורות לאחר הפיגוע הרסו כוחות צה"ל את ביתו של מחבל הג'יהאד האיסלאמי בבית לחם וליד שחאדה. לפי המקורות הפלשתינים בישראל חושדים כי שחאדה הוא שהכווין את המחבל עלאא' אבו דהים. אותם מקורות מוסיפים כי בתקופה האחרונה התרבו הידיעות כי שחאדה פועל בעצם בשטחי הגדה המערבית לטובת ארגון החיזבאללה.
אתר המקורב לג'יהאד האיסלאמי ציין כי המחבל עלאא' הישאם אבו דהים היה מיודד עם אלח'טיב ונראה כי השניים היו חברים באותו תא טרור. עוד נכתב באתר כי שני בתים של מחבלי הג'יהאד האיסלאמי בבית לחם נהרסו ביום חמישי בלילה בשל טענת ישראל כי הם הכווינו את הרוצח. כלומר, לפי אתר זה הג'יהאד האיסלאמי היה זה שסיפק את התשתית הלוגיסטית לביצוע הפיגוע אם כי המחבל עצמו לא נמנה על שורותיו.
בצה"ל מכחישים את הקשר ואומרים כי הריסת הבית היתה בגלל פעילות המחבל בג'יהאד-האיסלמי ולא מעבר לכך. כלי התקשורת הקשורים בחיזבאללה עסקו בעניין בהרחבה. ברשת אלמנאר אף פורסמה כתבה תחת הכותרת "האם החל מסע התגובה בעקבות חיסול עימאד מע'נייה?"
אף אירגון מוכר לא לקח אחריות לפיגוע הקטלני בישיבת מרכז הרב בירושלים. ההודעה היחידה על לקיחת האחריות הייתה ברשת אלמנאר של החיזבאללה מפי ארגון "חופשיי הגליל". מספר אתרי אינטרנט פלשתינים מזכירים כי אין זו הפעם הראשונה בה ארגון זה לוקח על עצמו אחריות לפיגועים.
אתר אחד ציין את המקרה שאירע באוגוסט 2007 אז ניסה תושב כפר מנדה שבגליל לתקוף מאבטח של ישיבת עטרת כוהנים בירושלים. התוקף אחמד אל חטיב , תושב כפר מנדה, נורה למוות על ידי המאבטח בתקרית שתועדה במצלמות האבטחה. אז נמסר בהודעות לתקשורת כי אלחטיב היה חבר בארגון "חופשיי הגליל".
בסוכנות הידיעות הפלשתינית "מעאן" צוטט גורם אלמוני שסיפר כי "חוליית חופשיי הגליל" תכננה את הפיגוע במשך עשרה ימים, וסיפקה למחבל את הנשק הנדרש לבצוע ואת העזרה הלוגיסטית הנדרשת בכל שלבי הפיגוע. "פעילי חופשיי הגליל" הכירו את המחבל, כפעיל לשעבר בתנועת חמאס דרך אל-חטיב, מבצע פיגוע הדקירה בירושלים. שני המחבלים היו חברים.
האלמוני הדגיש כי למרות העבר של מבצע הפיגוע בירושלים שקושר אותו לתנועת חמאס, האירגון בעזה לא יודיע שום דבר על הפיגוע. לדבריו חמאס החוץ היא שתיאמה את הפיגוע. דובר גדודי אל קסאם, הזרוע הצבאי של חמאס, אבו ועוביידה הכחיש שהגדודים נטלו את האחריות לפיגוע.
אבו עוביידה הוסיף שגדודי אל קסאם יודיעו על נטילת אחריות באופן רשמי אם יתברר שפעילים משלה הם שביצעו את הפיגוע אבל עד עכשיו הם לא נוטלים שום אחריות.