חוקרי מפלג המיעוטים עצרו לחקירה לפני כשבועיים שבעה ערבים, תושבי שועפת, החשודים בחטיפה. כמו כן נעצר יהודי מישוב הסמוך לירושלים בחשד שסחר עימם בכדורי תחמושת.
מחקירת החשודים עולה כי פעלו כחוליה של המשטרה הפלסטינית בתחומי ירושלים, הזדהו כשוטרי הרשות הפלסטינית ונהגו לאיים ולחטוף תושבים ממזרח ירושלים לחקירה במשרדי המשטרה ברמאללה בנושאים שונים.
עוד עולה בחקירה כי בתאריך 22.7.08 עצרו רכב של ערביה נוצריה בבית חנינה, הוציאו מרכבה את שני ילדיה בני 5 ו – 9 וחטפו אותם לרמאללה, שם מתגוררת משפחתו של בעלה המנוח. הילדים הובאו לבנין מושל רמאללה והוחזרו לאמם רק לאחר שכפו עליה לחתום בפני המושל על מסמך הקובע הסדרי ראייה של הילדים ע"י משפחת הבעל.
בחיפוש בבתי החשודים נתפסה בביתו של החשוד אוסמה מוחמד עלי חותמת בה משתמש לחתימת מסמכיו והמציינת כי הינו מזכיר הפתח באזור שועפאת.
בנוסף עולה מהחקירה כי גבר יהודי מישוב הסמוך לירושלים, שהינו בעל אישור לניהול מטווחי ירי, נהג לרכוש אלפי כדורי תחמושת מחנויות מורשות בעיר ולמוכרם לחוליה, החשוד נחקר ונעצר עד לתום ההליכים.
במסגרת החקירה נעצר אמש עורך דינו של אחד מהחשודים ונחקר כחשוד במעורבות בחטיפת 2 הילדים ושימש ככוח המניע והמכווין בביצוע החטיפה, בסיום חקירתו שוחרר בערבויות.
כמו כן בעת מעצרם של חברי החוליה במחנה שועפאת הושלכה לבנה לעבר קצין משטרה מהיחידה המרכזית וכעבור מספר ימים נעצר אחיו של אחד החשודים, נחקר , הודה ונעצר עד לתום ההליכים.
מעצרם של שניים מארבעת החשודים שהובאו היום לבימ"ש השלום בירושלים הוארך והשניים האחרים שוחררו בתנאים מגבילים.