סימנים להתנגשות אלימה בין חמאס לפתח' באיו"ש. גדודי עיז א-דין אל-קסאם, הזרוע הצבאית של חמאס, פרסמו (17 בספטמבר 2008) הודעה חריגה בה נקראו פעילי הארגון ("לוחמי הג'יהאד") באיו"ש להגן עצמם בכל האמצעים אם ייעשה ניסיון לעצור אותם ע"י "המנגנונים (של הרש"פ) הסוכנים הפועלים כארגון הכפוף לצבא הישראלי". משמעות הנחיה זו – "אור ירוק" לפיגועים נגד כוחות הביטחון של מנגנוני הביטחון של אבו מאזן.
חמאס הזהיר את מנגנוני הביטחון של אבו מאזן מהמשך דפוס ההתנהגות "הבוגדני" ש"תוקע סכין בגב ההתנגדות" ואשר "מקרב את קץ מנגנונים אלה באמצעות אינתיפאדה עממית נגדם".
עוד האשים חמאס את שלטון אבו מאזן בתיאום ביטחוני עם ישראל על מנת לרדוף את לוחמי הג'יהאד של חמאס במטרה לחסלם. קצפו של הארגון יצא בעקבות מעצר של שני פעילי חמאס צבאיים בעיר חברון שנכללו ברשימת המבוקשים של ישראל.
בדרך דומה של איומים נקט חמאס גם בפרשת מותו בכלא הרשות הפלשתינית של פעיל החמאס מג'ד אל-ברגותי בתחילת השנה. הארגון פרסם את שמות האחראים לעינויים שעבר מג'ד אל-ברגותי בכלא ואשר הביאו למותו ואת מקום מגוריהם במעין התרת דם פומבית של האחראים ל"רצח". בהודעה רשמית אחרת האשימו גדודי עיז א-דין אל-קסאם, הזרוע הצבאית של החמאס, את מנגנון המודיעין הכללי והעומד בראשו תוופיק טיראווי באחריות מלאה ל"הירצחו" של מג'ד אל-ברגותי, ומשמעות הדברים - דינו כדין כל רוצח.
בכיר בחמאס אף קרא לציבור הפלשתיני להוציא מתוכו את המתנדב שירצח את אבו מאזן.