מספר הסטודנטים החדשים שיתחילו את שנת לימודיהם הראשונה באוניברסיטת בן גוריון נמוך בשנת תשס"ט בשיעור של כ- 5% לעומת אשתקד, כך נמסר לקראת פתיחת שנת הלימודים האקדמית תשס"ט ביום ראשון הקרוב.
בשלוש השנים האחרונות חלה עליה בשיעור של כ- 10% מדי שנה במספר הלומדים לתואר דוקטור (PhD) באוניברסיטה ובשנה שהסתיימה למדו כ-1.200 סטודנטים לתואר זה. בסך הכל, ילמדו באוניברסיטת בן-גוריון למעלה מ-17.000 סטודנטים, מהם כ- 700 סטודנטים בקמפוס האוניברסיטה באילת הלומדים לתואר ראשון ולתואר שני (לעומת 640 אשתקד), נתונים המשקפים עליה בשיעור של כ- 10%.
נשיאת האוניברסיטה, פרופ' רבקה כרמי, הדגישה כי "למרות המצוקה התקציבית הצפויה כתוצאה מעליה משמעותית בהוצאות ההפעלה מול ירידה בהכנסות הוועדה לתכנון ולתקצוב במועצה להשכלה גבוהה הקשורות במשבר שוק ההון העולמי, האוניברסיטה תמשיך בקידום המטרות המרכזיות שהציבה לעצמה: חיזוק המצוינות המחקרית בכלל ובמיוחד הובלה במחקר רב תחומי בנושאי סביבה, אנרגיה ומים, המשך שיפור איכות ההוראה והרחבת המעורבות הטכנולוגית והחברתית בקהילה".
רקטור האוניברסיטה, פרופ' ג'ימי וינבלט, והמזכיר האקדמי, אברהם בר-און מסרו כי בהתאם למתווה האוטונומיה שנקבע על ידי המועצה להשכלה גבוהה, נפתחו באוניברסיטה מספר תכניות אקדמיות חדשות ללימודי מאסטר (תואר שני): האחת, בניהול ארגונים ללא כוונות רווח במסגרת בית הספר לניהול, השנייה-לימודי מגדר במסגרת הפקולטה למדעי הרוח והחברה, השלישית-בניהול ויישוב סכסוכים, שנועדה להכשיר אנשי מקצוע וחוקרים בחקר סכסוכים ובמציאת דרכים לפתרונם וכן תכנית לימודים חדשה בתולדות האמנות ותרבות חזותית במסגרת המחלקה לאמנות. כמו כן, נפתח מסלול ללימודי תקשורת (מדיה) ללא תזה, במקביל למסלול הרגיל-עם תזה.
יצוין, כי במסגרת קידום המחקר ובמטרה לעודד קליטת סטודנטים לתארים מתקדמים, האוניברסיטה מציעה גם השנה את "מלגות הנגב" היוקרתיות והתחרותיות. כך למשל, ללומדים לתואר 'דוקטור' (PhD) בכל התחומים, מוצעת מלגה בסך של 320.000 שקל, על בסיס מצוינות אקדמית, למשך כל תקופת לימודי הדוקטורט. מלגות מיוחדות יוענקו לתלמידי תואר שני העוסקים במחקר בינתחומי. זאת, בנוסף לפרס הכניסה ע"ש 'סוזן זלוטובסקי' שיוענק למועמדים מצטיינים לתואר ראשון לשנת הלימודים תשס"ט, בתוספת של מענק דיור למועמדים אלה.