החתימה הגנטית של אנשים בספרד ופורטוגל מספקת הוכחה להתבוללות ההמונית שנעשתה בקרב יהודי ספרד והמוסלמים והתנצרותם במאות ה-15 וה-16, לאחר שהצבאות הנוצרים השתלטו מחדש על ספרד מידי השליטה המוסלמית, כך דיווחו קבוצה של גנטיקאים.
ל-20% מהאוכלוסייה של איבריה פניסולה יש אבות יהודים ספרדים, ו-11% נושאים מטען גנטי של אבות מוריים. ההיסטוריונים התווכחו בקשר לשאלת כמה יהודים המירו את דתם בשנים הללו תחת לחץ השלטון הנוצרי, וכמה מהם הוגלו מספרד ופורטוגל. "כולם המעיטו מאוד בשאלת המרת הדת", אמרה ג'יין ס. גרבר, מומחית להיסטוריה ספרדית באוניברסיטת העיר ניו-יורק.
הממצאים יכולים להתפרש על פי שתי השקפות לגבי ההיסטוריה הספרדית. ג'ונתן ס. ריי, פרופסור ללימודי יהדות באוניברסיטת ג'ורג'טאון, מסביר: "תיאוריה אחת, על פי ההיסטוריון קלאודיו סאנצ'ז אלבורנוז, טוענת כי האוכלוסייה הספרדית היא קאתולית וכל השפעות האחרות במדינה הן זרות. התיאוריה השנייה אומרת כי ספרד הועשרה על ידי השאלת מנהגים מכל אחת משלושת הדתות והתרבויות".
המחקר, המתבסס על תיאורית כרומוזום ה-Y, נערך על ידי ביולוגים בראשות מארק א. ג'ובלינג מאוניברסיטת לייסטר באנגליה ופרנצ'סקה קלפל פומפו פברה מאוניברסיטת ברצלונה. הם יצרו חתימת כרומוזום Y של גבר ספרדי על ידי חקירת הקהילה היהודית הספרדית, במקומות שאליהם היגרו היהודים לאחר גירוש ספרד בשנים 1492-6. הם גם אפיינו את כרומוזום ה-Y של הערבים והצבא הברברי שפלש לספרד בשנת 711, על פי עדויות של אנשים הגרים במרוקו ומערב הסהרה.
המחקר הגנטי החדש מראה כי הייתה כמות אדירה של יהודים מומרים בעקבות הפרעות שהתרחשו בספרד עקב החלפת השלטון והכפייה הדתית במדינה.
כרומוזום ה-Y נשאר ללא שינוי כאשר הוא מועבר מאב לבן. המחקר מצא כי הפרופורציה של ספרדים ומורים הנמצאים באוכלוסייה כיום היא כמו של האוכלוסייה שהייתה בספרד לאחר הגירוש של שנת 1942. כמות גדולה של אנשים עם אבות ספרדים יהודים נמצאו. ד"ר ריי מסביר "יהודים היוו חלק נכבד מהאוכלוסייה הספרדית עד הגירוש וההתנצרות ההמונית".
יוצרי המחקר העלו שאלה רצינית לגבי זהות הספרדים של היום. ד"ר קלפל בעצמו גילה כי ישנם סיכויים גדולים מאוד שאבות אבותיו היו יהודים ספרדיים. התוצאות אינן בטוחות לגמרי לגבי כל אחד באופן אישי, וכך גם לגביו, אבל שם משפחתו הינו של מקום בספרד, וידוע כי כאשר המירו היהודים את דתם הם שינו את שם משפחתם לשמות של המקומות בהם גרו.
ד"ר קלפל אינו מייחס לכך חשיבות רבה, הוא טוען כי ההיסטוריה המשפחתית שלו מורכבת מהמון פריטים שהתאחדו, וכרומוזום ה-Y שלו מספר לו רק על אחד מתוך השרשרת.
אבל כמוהו ישנם עוד רבים בספרד. חלקם מעוניינים לחזור וללמוד על ההיסטוריה היהודית המהווה חלק מהאישיות שלהם. אולי כך נוכל למצוא עוד חלק מהשבטים האבודים.