מרכז מורשת בגין העניק לפרופ' משה ארנס, יו"ר חבר הנאמנים של המרכז האוניברסיטאי אריאל בשומרון, תעודת הוקרה לשנת תשס"ט על מפעל חיים למען ביטחון ישראל, ומחקרו פורץ הדרך בנושא מרד גטו ורשה.
על המחקר שיופיע בספר 'דגלים מעל הגטו' מספר ארנס ביומן ערוץ 7 ומתייחס גם לסוגיות ביטחוניות ופוליטיות על סדר יומה של הציבוריות בישראל.
את מסקנות המחקר מתמצת פרופ' ארנס בציינו כי התברר ששני ארגונים ניהלו את המאבק על הגטו – ארגונו של אנילביץ' וארגון בית"ר שחלקו הוסתר ככל הנראה על ידי הממסד באותם ימים ומאז אותם ימים.
המחקר כולל גביית עדויות, מסמכים ותיעוד המגולל את אירועי אותם ימים. ארנס מיצר על שלא טיפל במחקר במשך שנים בהן היה טרוד בעניינים אחרים ובמהלכן נפטרו רבים מהעדים שהיו נוכחים באירועי המרד.
הוא מספר כי ארגונים כמו השומר הצעיר התייחסו לבית"רים כמו אל פאשיסטים ולכן היה קשה להם לחבור אליהם למאבק משותף מול הגרמנים.
ארנס מספר שהנותרים מלוחמי קבוצתו של אנילביץ' היו ממוקדים בתפיסותיה של התנועה העובדת ועל כן "היה חשוב להם לקחת את כל התהילה לארגונים שלהם. לא היו מעוניינים לחלק את התהילה על מה שאירע בגטו ורשה".
פרופ' ארנס התייחס כאמור גם לסוגיות ביטחוניות ופוליטיות שעל סדר יומה של ישראל, ולדבריו "כל הטיפול בחמאס הוא טיפול כושל מזה זמן רב". לדבריו הממשלה בהתנהלותה הכושלת אפשרה לאוכלוסיית הדרום להיות זמן רב תחת ירי הקסאם. "החלו במלחמה הזו מאוחר והפסיקו אותה מוקדם מדי. ברק אמר שמיצינו את המבצע למרות שלא הפסקנו את הירי ולא החזרנו את שליט".
למרות ביקורת זו על ממשלת אולמרט מעדיף ארנס שנתניהו יבחר ב'קדימה' כשותפה לממשלתו ולא את מפלגות הימין בשל העמדות הקיצוניות, לטעמו, אותן הן מבטאות. ארנס סבור שקואליציית ימין דתיים היא בעלת "מרכיבים שעמדתם סוטה מהעמדה שצריכה להיות לממשלה חדשה. באיחוד הלאומי יש את אנשי כהנא שאני מסתייג טוטאלית מעמדתם כלפי האוכלוסייה הערבית, ואני מסתייג מעמדת ליברמן כלפי הציבור הערבי. הוא גורם להם נזק רב כשהוא דוחק אותם", אומר ארנס הסבור כי דווקא עמדות ימין קיצוניות הן שמובילות את הציבור הערבי לזרועות התמיכה בארגוני הטרור.
לנוכח עמדתו זו סבור ארנס כי הקואליציה הרצויה היא קדימה, ליכוד והסיעות החרדיות.