שנה לאחר שהוגש כתב האישום ע"י המחלקה לחקירות שוטרים, ולמעלה מ-3 שנים לאחר הארוע הטראומטי של עמונה, יתחיל הבוקר (ב) שלב העדויות במשפטו של קצין היס"מ מוטי מהגר, שצולם כשהוא מפליא מכותיו במפגינים הישובים על רצפת אחד הבתים בעמונה, באופן פסיבי לחלוטין. מהגר מואשם ב-3 אישומים של תקיפה הגורמת חבלה ממשית, ובאישום אחד של חבלה חמורה.
בכתב האישום נכתב כי הקצין, המשמש כמפקד צוות ביס"מ ש"י, נכנס לבית 7 בעמונה, על מנת לפנות את הנוכחים בו, ואולם "ללא כל התראה מוקדמת, וללא כל התגרות מצדם של המתלוננים, ניגש אליהם הנאשם והיכה אותם באמצעות אלה, שכוונה לראשם ולפלג גופם העליון, ללא הצדקה ומבלי שהתעורר צורך לנקוט בדרך בה נקט". בהמשך מפורט האופן בו היכה הקצין מהגר את כל אחד מהמתלוננים, והנזקים שנגרמו להם עקב ההכאה.
במהלך שלב ההקראה, שהתקיים לפני כחצי שנה, ביקש מהגר מבית המשפט לבטל את כתב האישום נגדו, בטענה של "הגנה מן הצדק". לטענתו, הוא אינו נושא באשמה פלילית כיון שרק מילא פקודות שקיבל ממפקדיו: "ההוראה היתה לפנות את המבנה. אין פשרות. זאת הוראת הממשלה. כך קיבלו המפקדים וכך העבירו לפקודיהם". עורך דינו של מהגר טען שבסרט המתעד את מכותיו של מהגר, ניתן לראות את הקצין כשהוא "סובל מהעבודה הנוראית, שהוא צריך להשתמש בכוח כנגד אחיו". לסיום דבריו טען עו"ד קמר, שניהול המשפט נגד מהגר "יגרום נזק חברתי ויפצע אותנו, יפער פערים בין אחים. תוצאות המשפט הפלילי בטלות לעומת הנזקים החברתיים שיגרמו".
התובעת מטעם מח"ש, עו"ד מיכל פרידמן, טענה כי "לא מדובר במקרה זה במילוי פקודה, אלא בחריגה מן הפקודות שניתנו, שכן מדובר בהכאה בפלג גוף עליון, הכאה בראש, ואילו הפקודה התירה הכאה בפלג גוף תחתון".
השופטת אתי באום-ניקוטרה קבעה בהחלטתה, כי במרכז הדיון בתיק תעמוד השאלה "מה היו הפקודות שניתנו למפנים והאם הנאשם מילא את אותן פקודות או שמא חרג מהן".