ראש האגף המדיני ביטחוני במשרד הביטחון, האלוף במיל' עמוס גלעד, נועד בצהרים עם ראש הממשלה אהוד אולמרט ומסר לו מכתב התנצלות ובו נכתב: "ברצוני להביע התנצלותי על הדברים שאמרתי לעיתון מעריב ב 18.02.09 נגד רה"מ ונגד ממשלת ישראל. הדברים שנאמרו אינם מוצדקים, נאמרו בשגגה וטוב היה לולא היו הדברים נאמרים".
ראש הממשלה הגיב לדברים ואמר כי הוא מקבל את ההתנצלות על "הדברים הלא מוצדקים שאמרת בשגגה, נגדי ונגד ממשלת ישראל ולאור הערכתי אליך והכרותי עם פועלך המסור, רב השנים למען מדינת ישראל וביטחונה". עוד הוסיף ראש הממשלה ואמר כי בכוונתו לפעול לסיום הפרשה לאלתר.
יצוין כי פגישת ההתנצלות בין שני האישים התקיימה לבקשתו של האלוף גלעד שכזכור הודח מתפקידו כמתווך בין ראש הממשלה למצרים לאחר שננזף על ידי ראש הממשלה בעקבות הברים שהטיח בראש הממשלה בראיון ל'מעריב'.
האלוף גלעד קבע בראיון שהעיכוב שהשבתו של שליט נגרם בגלל התנהלותו של אולמרט. אולמרט מצידו זעם ובתום ישיבת הקבינט הביטחוני בה השתתף האלוף דרש את התנצלותו, לאחר שהוכיח במסמכים שהציג לשרי הקבינט כי אין בסיס להאשמותיו של גלעד.
גלעד לא התנצל וראש הממשלה החליט לנקוט אמש בצעד בלתי שגרתי כאשר הגיש תלונה לנציב שירות המדינה, שמואל הולנדר, ובה דרש לחקור את האלוף. "התבטאויותיו של מר גלעד, כפי שבאו לידי ביטוי בכתבה, הן חמורות במיוחד ויש בהן משום פגיעה לכאורה ביחסי החוץ של המדינה ובמעמדו של ראש הממשלה", נכתב במכתב התלונה.
מנגד עוררה החלטת אולמרט ביקורת חריפה במשרד הביטחון, שם טענו כי ראש הממשלה יכול להחליט החלטות כרצונו, אך החלטות אלה עשויות לפגוע בביטחון ישראל.