ארגון זכויות האדם ביש"ע שלח מכתב דחוף לאלוף פיקוד המרכז, גדי שמני בו הוא דורש ממנו לעצור ולהפסיק לאלתר ביצוע פעולות שיש להן משמעות מדינית, ואשר נעשות בהנחיית ובהשראת הדרג המדיני של הממשלה היוצאת.
לטענת הארגון, האלוף שמני ממשיך גם בימים אלה, ואפילו ביתר שאת, לבצע סדרה של פעולות המאפיינות את גישתה של הממשלה היוצאת, הן כלפי המתיישבים היהודים ביהודה ושומרון והן כלפי האוכלוסייה הערבית.
ישראל היא דמוקרטיה ולא פקידוקרטיה – טוענים בארגון – ולא יעלה על הדעת שפקיד גבוה בצה"ל ינצל את תקופת הדמדומים שבין הממשלות כדי לבצע סידרה של מחטפים הפוגעים אנושות בזכויות האדם הבסיסיות ביותר של מתיישבי יהודה ושומרון, ובין היתר: הזכות לבטחון, זכות הקניין, והזכות להליך משפטי הוגן.
במכתב לאלוף הפיקוד מוזכרות פעולות שלטוניות כגון: הריסת בית המדרש של ישיבת חומש, והחרמת הציוד שבתוכו. הריסת דיר בחוות פדרמן. בארגון מציינים כי שתי ההריסות בוצעו ללא צו ובניגוד לכל דין. היום התקיימה הריסה נוספת בחוות ארז הסמוכה לנחליאל
המשך פתיחת מחסומים וצירי-תנועה באופן המסכן חיי יהודים, כשהנימוק הרשמי, שנמסר בהודעת דובר צה"ל לעיתונאים, הוא "בהמשך למדיניות הדרג המדיני...במטרה לשפר משמעותית את איכות החיים של האוכלוסייה הפלשתינית באזור יהודה ושומרון".
"בודאי ידוע לך כי הדרג המדיני שאתה מבצע פעולות בשמו, כביכול, זכה לאי-אמון מובהק מצד ציבור הבוחרים ונשלח אל ספסלי האופוזיציה." – נאמר במכתב לשמני – "לא אחת נימקת פעולות בעייתיות שביצעת כאלוף פיקוד המרכז, בנימוק ש"מדינת ישראל היא מדינה דמוקרטית ועל כן צה"ל כפוף לדרג המדיני".
בארגון אומרים כי הבחירות האחרונות משקפות והמהפך המשמעותי בכל הנוגע ליחס להתיישבות ביהודה ושומרון ולסוגיית המאחזים, להחזרת ההתיישבות היהודית לחומש ולצפון השומרון, ולאיזונים הראויים בין הערכים של שמירה על חיי יהודים לעומת שיפור איכות החיים של הערבים. שמני נדרש לעצור לאלתר את כל הפעולות שיש להן משמעות מדינית, ולהמתין לכינונה ולכניסתה לתפקוד מלא של הממשלה החדשה, שתקום בשבועות הקרובים. כל התנהלות אחרת תהיה פגיעה אנושה בערכי הדמוקרטיה וזכויות האדם.