מנתונים שמפרסם מכון ירושלים לחקר ישראל לקראת ביקורו של האפיפיור עולה כי הקהילה הנוצרית בירושלים מונה כיום רק 14,000 נפש (מתוכם כ-2600 נזירים ואנשי כמורה זרים) וחלקה בכלל אוכלוסיית הבירה מגיע ל-2% בלבד לעומת כ-20% ב-1946.
במכון אומרים כי תוכנית ביקורו של האפיפיור מצביעה על מאמץ קתולי גדול לפעול למען הקהילות המקומיות הערביות. במיסות ההמוניות שיערוך האפיפיור בירושלים (ליד גת שמנים), בנצרת (בהר הקפיצה) ובבית לחם ישתתפו מרבית הנוצרים הערבים החיים בארץ הקודש.
"ביקור האפיפיור אמור לתת זריקת עידוד לקהילה הנוצרית המצטמקת בישראל יחד עם שורת צעדים וביניהם בניית פרויקטים למגורים למשפחות נוצריות צעירות וטיפוח מערכת החינוך, בה לומדים גם תלמידים מוסלמים רבים", אומרים במכון.
האפיפיור בנדיקטוס ה-16 מקווה כי ביקורו בארץ הקודש יפנה את תשומת הלב של העולם הקתולי והעולם הנוצרי למצבן הקשה של הקהילות הנוצריות הערביות. ממידע שנאסף על ידי ד"ר אמנון רמון ממכון ירושלים לחקר ישראל עולה כי קיים חשש גדול של ראשי הכנסייה מהיעלמותן של הקהילות הנוצריות המקומיות, המכונות לעיתים "האבנים החיות" והפיכת המקומות הקדושים ל"מוזיאונים" ללא קהילות חיות.
כך לדוגמא מרבית בניה של הקהילה הנוצרית בעיר, שמנתה בסוף תקופת המנדט הבריטי כ-31 אלף נפש הגרו לעבר הירדן או לחו"ל – בעיקר לארה"ב, קנדה ודרום אמריקה. למעשה רוב האוכלוסייה הנוצרית הלא-ערבית עזב את ירושלים. שיעור האוכלוסייה הנוצרית בירושלים הצטמצם מ-19% מכלל אוכלוסיית העיר ב-1946 ל-4.1% ב-1967 ולכ-2% כיום - 14,000 נפש מתוכם 2600 נזירים ואנשי כמורה זרים.
ד"ר רמון מוסר כי נוסף להידלדלות הדמוגרפית סובלת הקהילה הנוצרית בירושלים מפיצול פנימי. מתברר כי הקהילה הנוצרית הגדולה בירושלים היא הקתולית שמונה כ-4500 נפש. הקהילה היוונית-אורתודוכסית מונה 3500 נפש, הקהילה הארמנית - 1500 נפש, הקהילות הפרוטסטנטיות מונות 850 נפש, הקהילות הקופטית והסורית- אורתודוכסית כ-250 נפש כל אחת והאתיופית כ-60 נפש.
ביקור האפיפיור והנושאים הקשורים בו יידונו בערב עיון מיוחד שיערך ע"י מכון ירושלים לחקר ישראל בשיתוף עם מרכז ירושלים ליחסי יהודים ונוצרים והמרכז לחקר הנצרות באונ' העברית. הכנס הכנסייה הקתולית, העם היהודי ומדינת ישראל יתקיים ביום ב', 4 במאי 2009, בשעה 17.00 במכון ירושלים, ר"ח רד"ק 20 ,ירושלים.