הנשיא שמעון פרס אמר בפגישתו עם מזכ"ל האו"ם באן קי מון כי הדו"ח שחיבר האו"ם על פגיעת צה"ל במוסדות אונר"א ברצועת עזה במהלך מבצע עפרת יצוקה הוא דו"ח שערורייתי וישראל לא מקבלת אף מילה מהמסמך החד צדדי.
העיתונאי דוד בדין שעומד בראש מכון המחקר לחקר מדיניות מזרח התיכון אמר בראיון לערוץ 7 כי באן קי מון אינו עוין לישראל אלא הוא פשוט תמים, "המכון שאני עומד בראשו ערך תחקיר שהוזמן על ידי הפרלמנט האירופי שמטרתו הייתה לפענח מי האנשים שמשתייכים לאונר"א. זאת בשל השמועות שהופצו בעולם שמדובר באנשי טרור. המסקנות שלנו היו ברורות וחד משמעיות 80 אחוזים מהם משתייכים לחמאס. הדברים הוכחו בבחירות האחרונות שנערכו בקרב האיגודים המקצועיים של הפקידים והמורים באונר"א, מפלגת החמאס זכתה שם פה אחד. חמאס פועל בתוך מחנות הפליטים של אונר"א ומנהל באותן מחנות פליטים בסיסי טרור לכל דבר. אחרי שהעברנו את התחקיר לאיחוד הארופי, יצא מנכ"ל אונר"א בהכרזה שהוא יפטר 10,000 עובדים בעזה, בפועל אף אחד לא פוטר והוא אמר את זה רק כדי לצאת ידי חובה".
לדבריו, כל אותה תנועה שמדברת על זכות השיבה נוסדה במחנות הפליטים של אונר"א, "הם מקימים את תאי הטרור במחנות הפליטים בחסות האו"ם ובנוסף לפעולות הטרור וירי הטילים על ישראל הם מביאים לשם פליטים מכל רחבי הגלובוס, ככה עם פועלים למען השיבה של הפליטים".
בדין מאשים את הממשלות בישראל שממשיכות בעצמן להעלים עין מארגון אונר"א, "בבוקר ממשלת ישראל מעבירה להם מיליונים ואחר הצהריים הם יורים עלינו רקטות, המודיעין יודע היטב מי יושב במוסדות של אונר"א, אבל ישראל ממשיכה לשתף פעולה איתם, כי ישראל לא רוצה לפגוע בסטטוס קוו, ממשלת ישראל חייבת בעצמה להפסיק את שיתוף הפעולה עם אונר"א".