בטקס קבלת הפנים שהתקיים בנמל התעופה בן גוריון התקבל האפיפיור, בנדיקטוס ה-16, על ידי מרבית צמרת המדינה. באירוע נכחו נשיא המדינה, ראש הממשלה, השרים, חברי כנסת, ראשי הדתות בארץ ובכירים נוספים. מהאירוע נעדרו הרבנים הראשיים, שרי ש"ס ויו"ר הכנסת. הרבנים הראשיים הודיעו כי יסתפקו בקבלת האפיפיור בהיכל שלמה שבירושלים. יו"ר הכנסת הודיע שלא יגיע לאירוע בשל סיבות אישיות.
במהלך הטקס נשאו דברים נשיא המדינה פרס והאפיפיור עצמו.
הנשיא פרס הגדיר את ביקורו של האפיפיור כ"שליחות רוחנית חשובה מאין כמוה, שליחות של שלום, שליחות של זריעת סובלנות ועקירת העשבים השוטים של הפנאטיות".
פרס הביע הערכה למה שהגדיר כעמדותיו ופועליו של האפיפיור "להורדת מפלס השנאה והאלימות בעולמנו. אני בטוח שזה יהיה המשך הדיאלוג בין היהדות והנצרות ברוח הנביאים", הוסיף.
הנשיא המשיך והפליג בערך שיתוף הפעולה והשלום, האחווה וחופש הפולחן. הוא קבע כי ישראל מקדשת לחלוטין את חופש הפולחן של כל הדתות. יהיו מי שיאמרו, ולא במעט צדק, שדבריו אלה של הנשיא, כמו נאומים אחרים בנושא זה, מתעלמים מחופש הפולחן היהודי על הר הבית, חופש שנמנע כידוע.
על קבלת האורח אמר הנשיא פרס כי "מימי אברהם אבינו אנו שואפים שאדם לאדם יהיה אורח רצוי ומארח בעל מאור פנים. אוהלו של אברהם היה פתוח לארבע רוחות השמיים ללא קושי בכניסה ובאוויר צח".
האפיפיור עצמו הודה לנשיא על דבריו החמים ודיבר על היום העם היהודי עם ששילם מחיר כבד מעמים שאינם מקבלים את ערכי חופש האדם. הוא ציין את מחויבותו לזכר קורבנות השואה וייחל להאצת המהלכים לשלום בין ישראל לפלשתינים. הוא הזכיר בדבריו גם את עקרון שתי המדינות לשני עמים כמוביל לשלום.