בלשכת שר הביטחון אהוד ברק מבקשים היום להבהיר, כי הבנייה בישוב משכיות שבבקעה נעשית מכוח החלטת ממשלה משנת 82' ומוגבלת ל-20 יחידות דיור.
"בשנת 1982 התקבלה החלטת ממשלה להקמת היאחזות נח"ל משכיות ובה 180 יחידות דיור. ההיאחזות התקיימה בשטח במשך 15 שנה, בין השנים 1986 – 2001", מסבירים במשרד הביטחון, "בשנים 2001 – 2002 ישב במקום גדוד הנח"ל החרדי, ובשנת 2001, לאחר עזיבת גדוד הנח"ל החרדי את המקום, הוקמה במקום מדרשה חינוכית, הפועלת במקום עד היום".
"לאור האמור לעייל, נקבע על ידי גורמים משפטיים, כי במקום התקיים רצף התיישבותי, שאינו מצריך החלטת ממשלה מחודשת על הקמת היישוב. כמו כן, היישוב מהווה רצף טריטוריאלי בין בקעת הירדן לבקעת בית שאן", מוסיפים בלשכת ברק.
בלשכה מציינים עוד, כי בשנים 2005 – 2006 אישרו נציגי הממשלה את תחום השיפוט של היישוב ותוכנית בנייה ליישוב, לתכנון 100 יחידות דיור. בשנים אלו, התוכנית אושרה על ידי ראש הממשלה דאז, אריאל שרון, שר הביטחון דאז, שאול מופז, וממלא מקום ראש הממשלה, אהוד אולמרט.
בשנת 2008, אישר שר הביטחון ברק, להמשיך בהליכי התכנון לבנייה במשכיות, תוך הגבלה לבניית 20 יחידות דיור בלבד לאכלוס משפחות ממפוני גוש קטיף, בהתאם להתחייבות הממשלה לשכן אותם כקבוצה בבקעת הירדן.