תכניתו של אהוד ברק לפנות מאחזים מעוררת דאגה רבה בקרב ציבור המתיישבים ביו"ש המאוכזב מדרכו של בנימין נתניהו. השר בני בגין אומר בראיון לערוץ 7 כי אין לו ספק שמפעל ההתיישבות לא יפגע, "אני יודע שקיימת הערכה רבה בציבור בכללותו ובוודאי בממשלה הזו למפעל ההתיישבות הציוני, לצערי נאמרו בעבר על ידי ראשי הממשלות בישראל דברים שמוטב שלא היו נאמרים לאוזניים זרות, אך כיום כולם מודים שהתפתחותו של מפעל ההתיישבות ביהודה ושומרון חשובה מאוד והוא וחייבת להימשך".
השר בגין מרגיע ואומר כי לעת עתה אלו רק דיבורים, כלשונו, "לא שולחים דחפור לשטח ולא צפויה כל התפתחות בשבועות הקרובים, אני מקווה שהשכל והתבונה יביאו להידברות. יכול להיות שיצטרכו לעשות הבחנה בין מאחזים שהוקמו על קרקע פרטית ערבית לבין כאלה שלא, ברור שכל דבר צריך לעלות בקנה אחד עם החוק".
עוד הוא אומר כי הרוח שנושבת כיום מארה"ב היא רוח אחרת, "עמדת ארה"ב כיום היא עמדה קיצונית שלא הייתה קיימת בימי הממשל הקודם, צריך להשתדל לבוא איתם בדברים ולשכנע אותם ובודאי במה שנוגע לגידול הטבעי במפעל ההתיישבות, אבל כל זה לא נוגע לעניינים שלנו, אם יישוב או מאחז כזה או אחר בנוי על קרקע ערבית זו כבר שאלה ישראלית".
באשר לבנייה הבלתי חוקית של הערבים בנגב ובגליל אומר השר בגין כי הליכוד התחייב להילחם בתופעה "אני מפנה אותך להסכם הקואליציוני עם מפלגת העבודה שם דובר במפורש על כך שנפעל למניעת בנייה בלתי חוקית".
השר בני בגין שהתנגד לחוק הנכבה אומר כי אי אפשר לחוקק חוק שלא ניתן לאכוף אותו "המחוקק צריך לדאוג לכך שהחקיקה לא תהיה הצהרתית בלבד, במדינת ישראל יש לתת חופש ביטוי לכולם ולקבל בסבלנות את הדברים".
הוא אף אינו רואה בערביי ישראל סכנה או גיס חמישי "אני מגנה את הדברים, צריך ללמוד להאזין בסבלנות ובפרט אנחנו היהודים. גם בארה"ב מאפשרים את חופש הביטוי ואפשר אפילו לשרוף את דגל ארה"ב בפומבי. טוב שיש מיעוט ערבי שמיוצג בכנסת ויש גם דוגמאות טובות שאומרים מעל בימת הכנסת דברים נאים ומכובדים. כשהושבעתי לחבר כנסת לפני שלושה חודשים התרחב לבבי כשראיתי 120 אנשים שעומדים ומצהירים אמונים למדינת ישראל ולחוקיה".