הרשות הפלסטינית החליטה לסגור את משרד ערוץ אל-ג'זירה ברמאללה, ולהגיש תביעה נגד ראשיה בטענה שהערוץ מסית נגד אש"ף והרשות. בהודעה שפרסם משרד ההסברה ברשות, נאמר כי הערוץ "נוקט בהסתה ומקדיש שעות רבות של שידורים שיש בהם פגיעה באש"ף וברשות הפלסטינית".
המזרחן יוני בן מנחם אומר בראיון לערוץ 7 כי קצפו של יו"ר הרשות הפלסטינית, אבו מאזן, יצא על הערוץ לאחר שאל-ג'זירה שידרה בהרחבה את דבריו של פארוק קדומי, שאמר כי אבו-מאזן היה שותף יחד עם מוחמד דחלאן בחיסול יאסר ערפאת, "דבריו של קדומי פותחים את כל מהדורות החדשות של אל ג'זירה, קדומי ככל הנראה חש מאוים מהחלטתו של אבו מאזן לכנס בקרוב בבית לחם את הועידה השישית של הפתח' שתחליף את כל הגברדיה הותיקה של הארגון וקדומי מבין שהוא בין אלה שאמורים להיות מוחלפים באנשים צעירים יותר כמו מרואן ברגותי, חוסיין א שייך ודחלאן. מה שקדומי עושה בימים האחרונים זה להציג פרוטוקולים שאפשר להטיל ספק גדול באמינותם, שמציגים תמלולים של שיחות שהתקיימו כביכול בין ראש הממשלה אריאל שרון לאבו מאזן ודחלאן שתכננו יחדיו לחסל את ערפאת, קדומי הציג את הפרוטוקולים בפני המצלמות ובכל העולם הערבי רואים את זה".
לדבריו בפתח' חוששים שמי שעומד מאחורי הפרסומים אלה אנשי חמאס שחלקם עובדים ברשת אל-ג'זירה "בפתח' מאשימים את אל-ג'זירה שהם פוגעים באינטרס הפלסטיני, כי עד היום הפלסטינים טענו שישראל הרעילה את ערפאת ועכשיו הפרסומים האחרונים מסירים בעצם את האחריות למותו של ערפאת מישראל ומטילים אותה על אבו מאזן. אבו מאזן משוכנע שהחמאס עומד מאחורי הפרסומים ולכן הוא הורה לסגור את משרדי אל-ג'זירה ברמאללה".
בן מנחם משוכנע כי הטענה על קונספירציה עם ישראל לרצוח את ערפאת היא מופרכת "אם ישראל הייתה רוצה לחסל את ערפאת לא היינו זקוקים לשיתוף פעולה עם הפלסטינים, יש לנו מספיק זרועות ביטחון יעילות שיודעים לעשות את העבודה, כפי שיעידו הפרסומים הזרים על כל מיני פעולות חיסול שלטענת עיתונים זרים ישראל ביצעה, כמו החיסול של מורנייה ועוד".
הוא צופה כי עד שתכונס הועידה בבית לחם יפרצו אירועי אלימות נוספים בין אנשי הפתח' לחמאס, "הסכסוך ככל שזה נראה עכשיו רחוק מאוד מלהסתיים".